RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-206ENST00000548122 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-206ENST00000548122 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-206ENST00000548122 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-206ENST00000548122 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-206ENST00000548122 DAPK1P53355 1430 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 MAP3K1Q13233 1512 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 FOXD1Q16676 465 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 ZMYM3Q14202 1370 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 TNRQ92752 1358 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 ATP7AQ04656 1500 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 MLH3Q9UHC1 1453 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 ABCC5O15440 1437 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 PLEKHG5O94827 1062 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 ABCC1P33527 1531 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 HECW2Q9P2P5 1572 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 PIP4K2BP78356 416 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 PREX2Q70Z35 1606 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 POGKQ9P215 609 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 STK26Q9P289 416 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.77□□□□□ -1.16
PTPRB-206ENST00000548122 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 PTPRMP28827 1452 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 NCOA1Q15788 1441 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 IDI1Q13907 227 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 ATF3P18847 181 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 TONSLQ96HA7 1378 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC144AA2RUR9 1427 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 MBD5Q9P267 1494 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 ERBINQ96RT1 1412 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 TOM1O60784 492 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 ROCK1Q13464 1354 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-206ENST00000548122 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 NBR1Q14596 966 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 NUTM2FA1L443 756 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 ARHGEF5Q12774 1597 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 MADDQ8WXG6 1647 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 ARID3AQ99856 593 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 A0A0G2JS52 829 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 ARXQ96QS3 562 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 CERKQ8TCT0 537 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 KDM5CP41229 1560 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 HFM1A2PYH4 1435 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 ABCA6Q8N139 1617 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 AGLP35573 1532 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 NAIPQ13075 1403 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 RICTORQ6R327 1708 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 NPATQ14207 1427 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-206ENST00000548122 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 PTPRKQ15262 1439 aa7.64□□□□□ -1.19
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