RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545875.4

GOLGA3-207, Transcript of golgin A3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GOLGA3, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3-207ENST00000545875 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
GOLGA3-207ENST00000545875 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
GOLGA3-207ENST00000545875 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.02■□□□□ -0
GOLGA3-207ENST00000545875 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.02□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.02□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 ABCC2Q92887 1545 aa15.01□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 GGT6Q6P531 493 aa15.01□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 KANK1Q14678 1352 aa14.99□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.99□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.017e-8■■■□□ 15.3
GOLGA3-207ENST00000545875 PLCH2O75038 1416 aa14.98□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.97□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 TMF1P82094 1093 aa14.97□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.97□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.97□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.96□□□□□ -0.01
GOLGA3-207ENST00000545875 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.94□□□□□ -0.02
GOLGA3-207ENST00000545875 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.93□□□□□ -0.02
GOLGA3-207ENST00000545875 PANK3Q9H999 370 aa14.92□□□□□ -0.02
GOLGA3-207ENST00000545875 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.92□□□□□ -0.02
GOLGA3-207ENST00000545875 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GOLGA3-207ENST00000545875 PREX2Q70Z35 1606 aa14.91□□□□□ -0.02
GOLGA3-207ENST00000545875 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.91□□□□□ -0.02
GOLGA3-207ENST00000545875 RALBP1Q15311 655 aa14.9□□□□□ -0.02
GOLGA3-207ENST00000545875 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.9□□□□□ -0.02
GOLGA3-207ENST00000545875 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.9□□□□□ -0.02
GOLGA3-207ENST00000545875 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GOLGA3-207ENST00000545875 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.89□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.89□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.89□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.89□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.88□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 FANCAO15360 1455 aa14.88□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.87□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.86□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.86□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 ADGRL1O94910 1474 aa14.86□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 NLRP13Q86W25 1043 aa14.85□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.85□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 ASXL2Q76L83 1435 aa14.85□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.85□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.85□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 CDCA8Q53HL2 280 aa14.85□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 RAPGEF3O95398 923 aa14.84□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.84□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 SHROOM2Q13796 1616 aa14.83□□□□□ -0.03
GOLGA3-207ENST00000545875 ERBINQ96RT1 1412 aa14.83□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.046e-7■□□□□ 9.1
GOLGA3-207ENST00000545875 NUDCQ9Y266 331 aa14.82□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 PLA2R1Q13018 1463 aa14.82□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 A2MP01023 1474 aa14.81□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.81□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.81□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.8□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.8□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.8□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.8□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.79□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 CD109Q6YHK3 1445 aa14.79□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.78□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 KDM5CP41229 1560 aa14.78□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 TESK2Q96S53 571 aa14.78□□□□□ -0.04
GOLGA3-207ENST00000545875 ABCC1P33527 1531 aa14.77□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 MLECQ14165 292 aa14.76□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.75□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.75□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 STK26Q9P289 416 aa14.74□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.74□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.73□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.71□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 STAC3Q96MF2 364 aa14.71□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 ATP7AQ04656 1500 aa14.71□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.71□□□□□ -0.05
GOLGA3-207ENST00000545875 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.71□□□□□ -0.06
GOLGA3-207ENST00000545875 PLXNC1O60486 1568 aa14.7□□□□□ -0.06
GOLGA3-207ENST00000545875 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.7□□□□□ -0.06
GOLGA3-207ENST00000545875 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.69□□□□□ -0.06
GOLGA3-207ENST00000545875 UNC13BO14795 1591 aa14.69□□□□□ -0.06
GOLGA3-207ENST00000545875 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GOLGA3-207ENST00000545875 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.69□□□□□ -0.06
GOLGA3-207ENST00000545875 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.68□□□□□ -0.06
GOLGA3-207ENST00000545875 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GOLGA3-207ENST00000545875 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.68□□□□□ -0.06
GOLGA3-207ENST00000545875 NEUROD2Q15784 382 aa14.68□□□□□ -0.06
GOLGA3-207ENST00000545875 ATP10AO60312 1499 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms