RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSNARE1-204ENST00000519651 NOS1P29475 1434 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1-204ENST00000519651 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.99■■□□□ 1.43
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TSNARE1-204ENST00000519651 MROH2AA6NES4 1674 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-204ENST00000519651 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
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