RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 PROX2Q3B8N5 592 aa8.9□□□□□ -0.98
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.9□□□□□ -0.98
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL9A1P20849 921 aa8.89□□□□□ -0.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX12PQ92771 950 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 EPAS1Q99814 870 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.86□□□□□ -0.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.85□□□□□ -0.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 CFAP44Q96MT7 982 aa8.85□□□□□ -0.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 NBR1Q14596 966 aa8.83□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAP3K7O43318 606 aa8.82□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR70Q9NW82 654 aa8.82□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCAMP50895 628 aa8.81□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.81□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.79□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 E2F4Q16254 413 aa8.79□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDIA6Q15084 440 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-277P-201ENST00000516272 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.77□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFFO2Q5TF58 517 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 PACS2Q86VP3 889 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A0G2JS52 829 aa8.74□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRCH3Q96II8 777 aa8.73□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 WBP1LQ9NX94 342 aa8.73□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSKSQ9UJT2 592 aa8.71□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.71□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 RGS20O76081 388 aa8.7□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.69□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMAPO00193 183 aa8.68□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRSS12P56730 875 aa8.68□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 CERKQ8TCT0 537 aa8.68□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNC4Q03721 635 aa8.67□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 NBPF26B4DH59 902 aa8.66□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP4CP60510 307 aa8.66□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNMA3Q9UL41 463 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF40O75150 1001 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 OSBPP22059 807 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 TATDN2Q93075 761 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 C3orf80F5H4A9 247 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 PADI6Q6TGC4 694 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC4A3P48751 1232 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTRQ99707 1265 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL21Q9HBE4 155 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q6ZNB5 142 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLF2Q8IX21 1173 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 NECTIN2Q92692 538 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 APLP1P51693 650 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC13Q8NBP0 860 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF516Q92618 1163 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUTM2FA1L443 756 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 COPS2P61201 443 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 P3H3Q8IVL6 736 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 EYA1Q99502 592 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTGDRQ13258 359 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 GFRA3O60609 400 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJB2P25686 324 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 GGCXP38435 758 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 LAPTM4AQ15012 233 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR14Q9BWN1 585 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM161AQ3B820 660 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEMA3EO15041 775 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZPR1O75312 459 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms