RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-397P-201ENST00000516226 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-397P-201ENST00000516226 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTPN5P54829 565 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-397P-201ENST00000516226 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-397P-201ENST00000516226 A0A0G2JS52 829 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 DPYSL4O14531 572 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 COL9A1P20849 921 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDIA6Q15084 440 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 PROX2Q3B8N5 592 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 CERKQ8TCT0 537 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RNU6-397P-201ENST00000516226 PACS2Q86VP3 889 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 NBR1Q14596 966 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRCH3Q96II8 777 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAP3K7O43318 606 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 BCAMP50895 628 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 E2F4Q16254 413 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 DDX12PQ92771 950 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 WDR70Q9NW82 654 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNC4Q03721 635 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 NECTIN2Q92692 538 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-397P-201ENST00000516226 NBPF26B4DH59 902 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-397P-201ENST00000516226 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-397P-201ENST00000516226 WBP1LQ9NX94 342 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRSS12P56730 875 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-397P-201ENST00000516226 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-397P-201ENST00000516226 TSKSQ9UJT2 592 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-397P-201ENST00000516226 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP4CP60510 307 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-397P-201ENST00000516226 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RNU6-397P-201ENST00000516226 LAPTM4AQ15012 233 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC4A3P48751 1232 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 CFAP44Q96MT7 982 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 TATDN2Q93075 761 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 OSBPP22059 807 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 PNMA3Q9UL41 463 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRR14Q9BWN1 585 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 IL21Q9HBE4 155 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLF2Q8IX21 1173 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 TTC13Q8NBP0 860 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-397P-201ENST00000516226 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-397P-201ENST00000516226 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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RNU6-397P-201ENST00000516226 MTRQ99707 1265 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-397P-201ENST00000516226 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-397P-201ENST00000516226 SMAPO00193 183 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-397P-201ENST00000516226 GGCXP38435 758 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-397P-201ENST00000516226 Q6ZNB5 142 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-397P-201ENST00000516226 P3H3Q8IVL6 736 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNF40O75150 1001 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-397P-201ENST00000516226 PADI6Q6TGC4 694 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-397P-201ENST00000516226 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-397P-201ENST00000516226 APLP1P51693 650 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 C3orf80F5H4A9 247 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 DNAJB2P25686 324 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 EYA1Q99502 592 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 GFRA3O60609 400 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZPR1O75312 459 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTGDRQ13258 359 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF516Q92618 1163 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-397P-201ENST00000516226 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-397P-201ENST00000516226 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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