RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.6□□□□□ -0.87
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.6□□□□□ -0.87
RRN3P1-201ENST00000514813 MYO5CQ9NQX4 1742 aa9.59□□□□□ -0.87
RRN3P1-201ENST00000514813 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RRN3P1-201ENST00000514813 A2MP01023 1474 aa9.58□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.58□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 ZMYM3Q14202 1370 aa9.58□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 FBXO3Q9UK99 471 aa9.57□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 NEUROD1Q13562 356 aa9.57□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 NBR1Q14596 966 aa9.57□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.57□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 MIA2Q96PC5 1412 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 EID1Q9Y6B2 187 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 ABCC5O15440 1437 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 DAPK1P53355 1430 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 PLEKHG5O94827 1062 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 PTPRMP28827 1452 aa9.53□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 ABCC1P33527 1531 aa9.52□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP7AQ04656 1500 aa9.52□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.52□□□□□ -0.88
RRN3P1-201ENST00000514813 MBD5Q9P267 1494 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 PIP4K2BP78356 416 aa9.52□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 PREX2Q70Z35 1606 aa9.51□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 IDI1Q13907 227 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.5□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.49□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 TNRQ92752 1358 aa9.49□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.49□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 NCOA1Q15788 1441 aa9.49□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.48□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 STK26Q9P289 416 aa9.48□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP3K1Q13233 1512 aa9.47□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 PTPRKQ15262 1439 aa9.47□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.46□□□□□ -0.89
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.46□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.46□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 MADDQ8WXG6 1647 aa9.45□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.45□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.44□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 NUTM2FA1L443 756 aa9.44□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.44□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.44□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.43□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 RICTORQ6R327 1708 aa9.43□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.42□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 ABCA6Q8N139 1617 aa9.42□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.42□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.41□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.41□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.41□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.41□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.4□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 LTKP29376 864 aa9.4□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.4□□□□□ -0.9
RRN3P1-201ENST00000514813 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.4□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 DUOX2Q9NRD8 1548 aa9.4□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 KDM5CP41229 1560 aa9.39□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.39□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.38□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.38□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.37□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 CERKQ8TCT0 537 aa9.37□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 NAIPQ13075 1403 aa9.36□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 ERBINQ96RT1 1412 aa9.36□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.36□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 POGKQ9P215 609 aa9.36□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RRN3P1-201ENST00000514813 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms