RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499392.1

LRAT-202, Transcript of lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LRAT, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRAT-202ENST00000499392 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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LRAT-202ENST00000499392 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
LRAT-202ENST00000499392 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
LRAT-202ENST00000499392 ARHGAP33O14559 1287 aa9.46□□□□□ -0.9
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LRAT-202ENST00000499392 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
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LRAT-202ENST00000499392 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.44□□□□□ -0.9
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LRAT-202ENST00000499392 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.43□□□□□ -0.9
LRAT-202ENST00000499392 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.43□□□□□ -0.9
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LRAT-202ENST00000499392 KCNK17Q96T54 332 aa9.42□□□□□ -0.9
LRAT-202ENST00000499392 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.41□□□□□ -0.9
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LRAT-202ENST00000499392 KCNH8Q96L42 1107 aa9.36□□□□□ -0.91
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LRAT-202ENST00000499392 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.31□□□□□ -0.92
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LRAT-202ENST00000499392 ABCC9O60706 1549 aa9.29□□□□□ -0.92
LRAT-202ENST00000499392 C3orf80F5H4A9 247 aa9.28□□□□□ -0.92
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LRAT-202ENST00000499392 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.28□□□□□ -0.92
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LRAT-202ENST00000499392 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.24□□□□□ -0.93
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LRAT-202ENST00000499392 EYA1Q99502 592 aa9.23□□□□□ -0.93
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LRAT-202ENST00000499392 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
LRAT-202ENST00000499392 FAM161AQ3B820 660 aa9.21□□□□□ -0.94
LRAT-202ENST00000499392 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.21□□□□□ -0.94
LRAT-202ENST00000499392 NBPF26B4DH59 902 aa9.2□□□□□ -0.94
LRAT-202ENST00000499392 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.2□□□□□ -0.94
LRAT-202ENST00000499392 NBPF3Q9H094 633 aa9.2□□□□□ -0.94
LRAT-202ENST00000499392 SMAPO00193 183 aa9.19□□□□□ -0.94
LRAT-202ENST00000499392 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.19□□□□□ -0.94
LRAT-202ENST00000499392 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
LRAT-202ENST00000499392 PNMA3Q9UL41 463 aa9.19□□□□□ -0.94
LRAT-202ENST00000499392 OATP04181 439 aa9.18□□□□□ -0.94
LRAT-202ENST00000499392 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
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LRAT-202ENST00000499392 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
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LRAT-202ENST00000499392 CCDC102AQ96A19 550 aa9.17□□□□□ -0.94
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LRAT-202ENST00000499392 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
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LRAT-202ENST00000499392 STAC3Q96MF2 364 aa9.12□□□□□ -0.95
LRAT-202ENST00000499392 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.12□□□□□ -0.95
LRAT-202ENST00000499392 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.12□□□□□ -0.95
LRAT-202ENST00000499392 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
LRAT-202ENST00000499392 DNAJB2P25686 324 aa9.11□□□□□ -0.95
LRAT-202ENST00000499392 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
LRAT-202ENST00000499392 TRIM66O15016 1216 aa9.1□□□□□ -0.95
LRAT-202ENST00000499392 AMHR2Q16671 573 aa9.09□□□□□ -0.95
LRAT-202ENST00000499392 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.09□□□□□ -0.95
LRAT-202ENST00000499392 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.09□□□□□ -0.95
LRAT-202ENST00000499392 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
LRAT-202ENST00000499392 NLRP7Q8WX94 980 aa9.08□□□□□ -0.96
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