RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
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RABGGTB-210ENST00000485459 STAC3Q96MF2 364 aa10.88□□□□□ -0.67
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RABGGTB-210ENST00000485459 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa10.86□□□□□ -0.67
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RABGGTB-210ENST00000485459 NUTM2FA1L443 756 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-210ENST00000485459 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-210ENST00000485459 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.74□□□□□ -0.69
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RABGGTB-210ENST00000485459 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.72□□□□□ -0.69
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RABGGTB-210ENST00000485459 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-210ENST00000485459 PRSS12P56730 875 aa10.71□□□□□ -0.69
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RABGGTB-210ENST00000485459 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
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RABGGTB-210ENST00000485459 SLC24A1O60721 1099 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGGTB-210ENST00000485459 WNT2BQ93097 391 aa10.66□□□□□ -0.7
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RABGGTB-210ENST00000485459 SOWAHBA6NEL2 793 aa10.53□□□□□ -0.72
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RABGGTB-210ENST00000485459 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.48□□□□□ -0.73
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RABGGTB-210ENST00000485459 NYAP1Q6ZVC0 841 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-210ENST00000485459 SLF2Q8IX21 1173 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-210ENST00000485459 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-210ENST00000485459 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-210ENST00000485459 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-210ENST00000485459 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-210ENST00000485459 NECTIN2Q92692 538 aa10.41□□□□□ -0.74
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