RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 PTPREP23469 700 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRC-211ENST00000484135 THSD4Q6ZMP0 1018 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
PTPRC-211ENST00000484135 PDIA6Q15084 440 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRC-211ENST00000484135 WNT2BQ93097 391 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRC-211ENST00000484135 PHF14O94880 888 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0G2JS52 829 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRC-211ENST00000484135 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRC-211ENST00000484135 TYW1BQ6NUM6 668 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRC-211ENST00000484135 DDX12PQ92771 950 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM33Q9BZ11 813 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF3Q9H094 633 aa10.86□□□□□ -0.67
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PTPRC-211ENST00000484135 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PTPRC-211ENST00000484135 EPAS1Q99814 870 aa10.84□□□□□ -0.67
PTPRC-211ENST00000484135 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
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PTPRC-211ENST00000484135 P3H3Q8IVL6 736 aa10.81□□□□□ -0.68
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PTPRC-211ENST00000484135 PROX2Q3B8N5 592 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZNB5 142 aa10.71□□□□□ -0.69
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PTPRC-211ENST00000484135 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRC-211ENST00000484135 OSBPP22059 807 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-211ENST00000484135 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-211ENST00000484135 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
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PTPRC-211ENST00000484135 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 BCAMP50895 628 aa10.64□□□□□ -0.71
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PTPRC-211ENST00000484135 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1468Q9P260 1216 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 SOWAHBA6NEL2 793 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 SEMA3EO15041 775 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 KCNC4Q03721 635 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 CERKQ8TCT0 537 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 LAPTM4AQ15012 233 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-211ENST00000484135 PRSS12P56730 875 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRC-211ENST00000484135 PACS2Q86VP3 889 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRC-211ENST00000484135 TSKSQ9UJT2 592 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRC-211ENST00000484135 WBP1LQ9NX94 342 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-211ENST00000484135 NUTM2FA1L443 756 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF26B4DH59 902 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRC-211ENST00000484135 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRC-211ENST00000484135 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRC-211ENST00000484135 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
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PTPRC-211ENST00000484135 PADI6Q6TGC4 694 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 LRCH3Q96II8 777 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 PNMA3Q9UL41 463 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 SMAPO00193 183 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 FAM198AQ9UFP1 575 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 HPS5Q9UPZ3 1129 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 GFRA3O60609 400 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 TATDN2Q93075 761 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 PTGDRQ13258 359 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 NUDT18Q6ZVK8 323 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PTPRC-211ENST00000484135 TRAF7Q6Q0C0 670 aa10.47□□□□□ -0.73
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PTPRC-211ENST00000484135 FCHSD2O94868 740 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRC-211ENST00000484135 PPP4CP60510 307 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRC-211ENST00000484135 TTC13Q8NBP0 860 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRC-211ENST00000484135 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRC-211ENST00000484135 RNF40O75150 1001 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRC-211ENST00000484135 SAMD7Q7Z3H4 446 aa10.42□□□□□ -0.74
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PTPRC-211ENST00000484135 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRC-211ENST00000484135 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRC-211ENST00000484135 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRG1Q9Y653 693 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRC-211ENST00000484135 FAM161AQ3B820 660 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRC-211ENST00000484135 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRC-211ENST00000484135 EYA1Q99502 592 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRC-211ENST00000484135 GNPATO15228 680 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRC-211ENST00000484135 SLC4A3P48751 1232 aa10.34□□□□□ -0.75
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