RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.06■■□□□ 1.92
SYF2-204ENST00000476231 DEPDC5O75140 1603 aa27.05■■□□□ 1.92
SYF2-204ENST00000476231 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SYF2-204ENST00000476231 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
SYF2-204ENST00000476231 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.03■■□□□ 1.92
SYF2-204ENST00000476231 DIP2BQ9P265 1576 aa27.02■■□□□ 1.92
SYF2-204ENST00000476231 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.02■■□□□ 1.92
SYF2-204ENST00000476231 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SYF2-204ENST00000476231 HECW2Q9P2P5 1572 aa27■■□□□ 1.91
SYF2-204ENST00000476231 ATP10AO60312 1499 aa26.95■■□□□ 1.91
SYF2-204ENST00000476231 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.94■■□□□ 1.9
SYF2-204ENST00000476231 A2MP01023 1474 aa26.94■■□□□ 1.9
SYF2-204ENST00000476231 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.94■■□□□ 1.9
SYF2-204ENST00000476231 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.93■■□□□ 1.9
SYF2-204ENST00000476231 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SYF2-204ENST00000476231 KANK1Q14678 1352 aa26.93■■□□□ 1.9
SYF2-204ENST00000476231 PLA2R1Q13018 1463 aa26.93■■□□□ 1.9
SYF2-204ENST00000476231 RICTORQ6R327 1708 aa26.91■■□□□ 1.9
SYF2-204ENST00000476231 KIF3BO15066 747 aa26.91■■□□□ 1.9
SYF2-204ENST00000476231 TET3O43151 1660 aa26.9■■□□□ 1.9
SYF2-204ENST00000476231 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.9■■□□□ 1.9
SYF2-204ENST00000476231 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.9■■□□□ 1.9
SYF2-204ENST00000476231 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
SYF2-204ENST00000476231 E9PCH4 1651 aa26.88■■□□□ 1.89
SYF2-204ENST00000476231 ABCA6Q8N139 1617 aa26.88■■□□□ 1.89
SYF2-204ENST00000476231 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SYF2-204ENST00000476231 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.86■■□□□ 1.89
SYF2-204ENST00000476231 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.86■■□□□ 1.89
SYF2-204ENST00000476231 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.86■■□□□ 1.89
SYF2-204ENST00000476231 RAPGEF3O95398 923 aa26.86■■□□□ 1.89
SYF2-204ENST00000476231 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SYF2-204ENST00000476231 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
SYF2-204ENST00000476231 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SYF2-204ENST00000476231 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.81■■□□□ 1.88
SYF2-204ENST00000476231 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.8■■□□□ 1.88
SYF2-204ENST00000476231 TRPM2O94759 1503 aa26.8■■□□□ 1.88
SYF2-204ENST00000476231 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.8■■□□□ 1.88
SYF2-204ENST00000476231 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SYF2-204ENST00000476231 PTPRTO14522 1441 aa26.8■■□□□ 1.88
SYF2-204ENST00000476231 TSPOAP1O95153 1857 aa26.79■■□□□ 1.88
SYF2-204ENST00000476231 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.78■■□□□ 1.88
SYF2-204ENST00000476231 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.77■■□□□ 1.88
SYF2-204ENST00000476231 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.75■■□□□ 1.87
SYF2-204ENST00000476231 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.75■■□□□ 1.87
SYF2-204ENST00000476231 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.74■■□□□ 1.87
SYF2-204ENST00000476231 CEP152O94986 1710 aa26.72■■□□□ 1.87
SYF2-204ENST00000476231 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.71■■□□□ 1.87
SYF2-204ENST00000476231 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SYF2-204ENST00000476231 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SYF2-204ENST00000476231 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.69■■□□□ 1.86
SYF2-204ENST00000476231 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.69■■□□□ 1.86
SYF2-204ENST00000476231 CLTCL1P53675 1640 aa26.68■■□□□ 1.86
SYF2-204ENST00000476231 RGL3Q3MIN7 710 aa26.67■■□□□ 1.86
SYF2-204ENST00000476231 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.66■■□□□ 1.86
SYF2-204ENST00000476231 CCER2I3L3R5 266 aa26.66■■□□□ 1.86
SYF2-204ENST00000476231 GGT6Q6P531 493 aa26.65■■□□□ 1.86
SYF2-204ENST00000476231 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.65■■□□□ 1.86
SYF2-204ENST00000476231 ABCC3O15438 1527 aa26.64■■□□□ 1.85
SYF2-204ENST00000476231 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.63■■□□□ 1.85
SYF2-204ENST00000476231 USP47Q96K76 1375 aa26.62■■□□□ 1.85
SYF2-204ENST00000476231 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SYF2-204ENST00000476231 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SYF2-204ENST00000476231 REREQ9P2R6 1566 aa26.6■■□□□ 1.85
SYF2-204ENST00000476231 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.6■■□□□ 1.85
SYF2-204ENST00000476231 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.59■■□□□ 1.85
SYF2-204ENST00000476231 STAC3Q96MF2 364 aa26.58■■□□□ 1.85
SYF2-204ENST00000476231 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.58■■□□□ 1.85
SYF2-204ENST00000476231 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.58■■□□□ 1.85
SYF2-204ENST00000476231 NPATQ14207 1427 aa26.58■■□□□ 1.84
SYF2-204ENST00000476231 ANP32CO43423 234 aa26.57■■□□□ 1.84
SYF2-204ENST00000476231 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SYF2-204ENST00000476231 CCDC7Q96M83 1385 aa26.55■■□□□ 1.84
SYF2-204ENST00000476231 LAMC1P11047 1609 aa26.55■■□□□ 1.84
SYF2-204ENST00000476231 KIF1BO60333 1816 aa26.55■■□□□ 1.84
SYF2-204ENST00000476231 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.54■■□□□ 1.84
SYF2-204ENST00000476231 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.53■■□□□ 1.84
SYF2-204ENST00000476231 AGLP35573 1532 aa26.52■■□□□ 1.84
SYF2-204ENST00000476231 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.52■■□□□ 1.84
SYF2-204ENST00000476231 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.52■■□□□ 1.84
SYF2-204ENST00000476231 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SYF2-204ENST00000476231 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SYF2-204ENST00000476231 MADDQ8WXG6 1647 aa26.5■■□□□ 1.83
SYF2-204ENST00000476231 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.47■■□□□ 1.83
SYF2-204ENST00000476231 NOS1P29475 1434 aa26.47■■□□□ 1.83
SYF2-204ENST00000476231 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.46■■□□□ 1.83
SYF2-204ENST00000476231 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SYF2-204ENST00000476231 ADGRB3O60242 1522 aa26.45■■□□□ 1.83
SYF2-204ENST00000476231 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.45■■□□□ 1.82
SYF2-204ENST00000476231 MROH2AA6NES4 1674 aa26.44■■□□□ 1.82
SYF2-204ENST00000476231 IFT172Q9UG01 1749 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-204ENST00000476231 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-204ENST00000476231 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-204ENST00000476231 MYOM2P54296 1465 aa26.43■■□□□ 1.82
SYF2-204ENST00000476231 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SYF2-204ENST00000476231 PIK3C2BO00750 1634 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-204ENST00000476231 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.4■■□□□ 1.82
SYF2-204ENST00000476231 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.4■■□□□ 1.82
SYF2-204ENST00000476231 SYNMO15061 1565 aa26.39■■□□□ 1.82
SYF2-204ENST00000476231 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.35■■□□□ 1.81
SYF2-204ENST00000476231 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms