RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.8■■■■□ 3.32
OPN3-204ENST00000469376 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.32
OPN3-204ENST00000469376 AFAP1Q8N556 730 aa35.77■■■■□ 3.32
OPN3-204ENST00000469376 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.76■■■■□ 3.32
OPN3-204ENST00000469376 TSPOAP1O95153 1857 aa35.75■■■■□ 3.31
OPN3-204ENST00000469376 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
OPN3-204ENST00000469376 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
OPN3-204ENST00000469376 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
OPN3-204ENST00000469376 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
OPN3-204ENST00000469376 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.68■■■■□ 3.3
OPN3-204ENST00000469376 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.66■■■■□ 3.3
OPN3-204ENST00000469376 KIF15Q9NS87 1388 aa35.66■■■■□ 3.3
OPN3-204ENST00000469376 KIF7Q2M1P5 1343 aa35.65■■■■□ 3.3
OPN3-204ENST00000469376 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.65■■■■□ 3.3
OPN3-204ENST00000469376 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.62■■■■□ 3.29
OPN3-204ENST00000469376 PLXNC1O60486 1568 aa35.62■■■■□ 3.29
OPN3-204ENST00000469376 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
OPN3-204ENST00000469376 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.6■■■■□ 3.29
OPN3-204ENST00000469376 RAPGEF3O95398 923 aa35.58■■■■□ 3.29
OPN3-204ENST00000469376 KDM5CP41229 1560 aa35.57■■■■□ 3.29
OPN3-204ENST00000469376 ERICH6BQ5W0A0 696 aa35.57■■■■□ 3.28
OPN3-204ENST00000469376 ATP7AQ04656 1500 aa35.57■■■■□ 3.28
OPN3-204ENST00000469376 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.57■■■■□ 3.28
OPN3-204ENST00000469376 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
OPN3-204ENST00000469376 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.56■■■■□ 3.28
OPN3-204ENST00000469376 PKD2Q13563 968 aa35.55■■■■□ 3.28
OPN3-204ENST00000469376 CCDC184Q52MB2 194 aa35.54■■■■□ 3.28
OPN3-204ENST00000469376 MRS2Q9HD23 443 aa35.53■■■■□ 3.28
OPN3-204ENST00000469376 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.52■■■■□ 3.28
OPN3-204ENST00000469376 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
OPN3-204ENST00000469376 RICTORQ6R327 1708 aa35.51■■■■□ 3.28
OPN3-204ENST00000469376 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.5■■■■□ 3.27
OPN3-204ENST00000469376 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.5■■■■□ 3.27
OPN3-204ENST00000469376 USP47Q96K76 1375 aa35.49■■■■□ 3.27
OPN3-204ENST00000469376 ZBED9Q6R2W3 1325 aa35.49■■■■□ 3.27
OPN3-204ENST00000469376 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.48■■■■□ 3.27
OPN3-204ENST00000469376 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.47■■■■□ 3.27
OPN3-204ENST00000469376 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.45■■■■□ 3.27
OPN3-204ENST00000469376 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.44■■■■□ 3.26
OPN3-204ENST00000469376 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.44■■■■□ 3.26
OPN3-204ENST00000469376 NUP155O75694 1391 aa35.43■■■■□ 3.26
OPN3-204ENST00000469376 ERBINQ96RT1 1412 aa35.42■■■■□ 3.26
OPN3-204ENST00000469376 FAM9BQ8IZU0 186 aa35.42■■■■□ 3.26
OPN3-204ENST00000469376 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
OPN3-204ENST00000469376 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
OPN3-204ENST00000469376 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
OPN3-204ENST00000469376 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
OPN3-204ENST00000469376 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.36■■■■□ 3.25
OPN3-204ENST00000469376 ANP32EQ9BTT0 268 aa35.36■■■■□ 3.25
OPN3-204ENST00000469376 ABCA6Q8N139 1617 aa35.32■■■■□ 3.24
OPN3-204ENST00000469376 A2MP01023 1474 aa35.31■■■■□ 3.24
OPN3-204ENST00000469376 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.3■■■■□ 3.24
OPN3-204ENST00000469376 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
OPN3-204ENST00000469376 PPP4R2Q9NY27 417 aa35.29■■■■□ 3.24
OPN3-204ENST00000469376 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.29■■■■□ 3.24
OPN3-204ENST00000469376 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.27■■■■□ 3.24
OPN3-204ENST00000469376 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
OPN3-204ENST00000469376 UNC13BO14795 1591 aa35.25■■■■□ 3.23
OPN3-204ENST00000469376 KIF3BO15066 747 aa35.23■■■■□ 3.23
OPN3-204ENST00000469376 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
OPN3-204ENST00000469376 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
OPN3-204ENST00000469376 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.21■■■■□ 3.23
OPN3-204ENST00000469376 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.19■■■■□ 3.22
OPN3-204ENST00000469376 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
OPN3-204ENST00000469376 ATP10AO60312 1499 aa35.15■■■■□ 3.22
OPN3-204ENST00000469376 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
OPN3-204ENST00000469376 DEPDC5O75140 1603 aa35.14■■■■□ 3.22
OPN3-204ENST00000469376 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.13■■■■□ 3.21
OPN3-204ENST00000469376 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.11■■■■□ 3.21
OPN3-204ENST00000469376 E9PCH4 1651 aa35.1■■■■□ 3.21
OPN3-204ENST00000469376 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.08■■■■□ 3.21
OPN3-204ENST00000469376 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.07■■■■□ 3.21
OPN3-204ENST00000469376 KANK1Q14678 1352 aa35.07■■■■□ 3.21
OPN3-204ENST00000469376 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.06■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.06■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 REREQ9P2R6 1566 aa35.06■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 FANCIQ9NVI1 1328 aa35.04■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.04■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.04■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.04■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 NUDCQ9Y266 331 aa35.04■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 GGT6Q6P531 493 aa35.03■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.02■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.01■■■■□ 3.2
OPN3-204ENST00000469376 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
OPN3-204ENST00000469376 RALBP1Q15311 655 aa35■■■■□ 3.19
OPN3-204ENST00000469376 LAMC1P11047 1609 aa34.99■■■■□ 3.19
OPN3-204ENST00000469376 TMC1Q8TDI8 760 aa34.98■■■■□ 3.19
OPN3-204ENST00000469376 RNF123Q5XPI4 1314 aa34.97■■■■□ 3.19
OPN3-204ENST00000469376 AGLP35573 1532 aa34.96■■■■□ 3.19
OPN3-204ENST00000469376 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
OPN3-204ENST00000469376 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
OPN3-204ENST00000469376 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.94■■■■□ 3.18
OPN3-204ENST00000469376 PLA2R1Q13018 1463 aa34.92■■■■□ 3.18
OPN3-204ENST00000469376 TET3O43151 1660 aa34.9■■■■□ 3.18
OPN3-204ENST00000469376 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.9■■■■□ 3.18
OPN3-204ENST00000469376 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.5 ms