RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469325.5

VAV3-204, Transcript of vav guanine nucleotide exchange factor 3, human

TSL 2

Gene VAV3, Length 2,487 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAV3-204	ENST00000469325	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		7.17	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		7.17	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		7.17	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	7.17	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		7.16	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		7.16	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		7.16	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	CCER2	I3L3R5	266 aa		7.16	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	AFAP1	Q8N556	730 aa		7.15	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		7.15	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	PLXNC1	O60486	1568 aa		7.15	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		7.15	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		7.15	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		7.14	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	ABCC1	P33527	1531 aa		7.14	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		7.14	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		7.14	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		7.14	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	ASXL2	Q76L83	1435 aa		7.14	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		7.14	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	FANCA	O15360	1455 aa		7.13	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		7.13	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	UNC13B	O14795	1591 aa		7.12	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	CCDC7	Q96M83	1385 aa		7.12	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		7.12	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	RGL3	Q3MIN7	710 aa		7.12	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		7.12	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	USP47	Q96K76	1375 aa		7.12	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		7.11	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		7.11	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		7.11	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		7.11	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		7.11	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		7.1	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	ADGRL1	O94910	1474 aa		7.1	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		7.1	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		7.09	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		7.09	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	PLA2R1	Q13018	1463 aa		7.09	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		7.09	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
VAV3-204	ENST00000469325	KIF3B	O15066	747 aa		7.08	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	ATP7A	Q04656	1500 aa		7.08	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	KANK1	Q14678	1352 aa		7.08	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		7.08	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	KDM5C	P41229	1560 aa		7.07	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	ATP10A	O60312	1499 aa		7.07	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	CD109	Q6YHK3	1445 aa		7.07	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	SLC4A2	P04920	1241 aa		7.07	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		7.06	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		7.06	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	A2M	P01023	1474 aa		7.05	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		7.05	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	7.05	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		7.05	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		7.04	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	MRS2	Q9HD23	443 aa		7.04	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325		E9PCH4	1651 aa		7.04	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	DEPDC5	O75140	1603 aa		7.04	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		7.03	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	ABCB7	O75027	752 aa		7.03	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		7.03	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	CCDC184	Q52MB2	194 aa		7.03	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		7.03	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	STAC3	Q96MF2	364 aa		7.03	□□□□□ -1.28
VAV3-204	ENST00000469325	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		7.02	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	TET3	O43151	1660 aa		7.02	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	TRPM2	O94759	1503 aa		7.02	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	PTPRT	O14522	1441 aa		7.02	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		7.02	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		7.02	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		7.02	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		7.01	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	RAPGEF3	O95398	923 aa		7.01	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	GGT6	Q6P531	493 aa		7.01	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		7.01	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		7	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	NEO1	Q92859	1461 aa		7	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	NEFL	P07196	543 aa		7	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	TMF1	P82094	1093 aa		7	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	CEP152	O94986	1710 aa		6.99	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		6.99	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		6.99	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	CLTCL1	P53675	1640 aa		6.99	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		6.99	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	TMC1	Q8TDI8	760 aa		6.99	□□□□□ -1.29
VAV3-204	ENST00000469325	TESK2	Q96S53	571 aa		6.99	□□□□□ -1.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms