RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-204ENST00000461653 NBR1Q14596 966 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-204ENST00000461653 STAC3Q96MF2 364 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
RABGGTB-204ENST00000461653 COL9A1P20849 921 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGGTB-204ENST00000461653 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa11.49□□□□□ -0.57
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RABGGTB-204ENST00000461653 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGGTB-204ENST00000461653 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGGTB-204ENST00000461653 PROX2Q3B8N5 592 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGGTB-204ENST00000461653 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP3K7O43318 606 aa11.46□□□□□ -0.58
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
RABGGTB-204ENST00000461653 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGGTB-204ENST00000461653 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
RABGGTB-204ENST00000461653 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
RABGGTB-204ENST00000461653 NBPF3Q9H094 633 aa11.43□□□□□ -0.58
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RABGGTB-204ENST00000461653 HCSTQ9UBK5 93 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGGTB-204ENST00000461653 GOLGA8CPA6NN73 597 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGGTB-204ENST00000461653 OSBPP22059 807 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-204ENST00000461653 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-204ENST00000461653 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-204ENST00000461653 WNT2BQ93097 391 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-204ENST00000461653 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-204ENST00000461653 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-204ENST00000461653 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-204ENST00000461653 CERKQ8TCT0 537 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-204ENST00000461653 PTPN5P54829 565 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-204ENST00000461653 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-204ENST00000461653 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-204ENST00000461653 TSKSQ9UJT2 592 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-204ENST00000461653 CDCA7LQ96GN5 454 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-204ENST00000461653 PRSS12P56730 875 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGGTB-204ENST00000461653 PACS2Q86VP3 889 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGGTB-204ENST00000461653 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.29□□□□□ -0.6
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RABGGTB-204ENST00000461653 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
RABGGTB-204ENST00000461653 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGGTB-204ENST00000461653 SEMA3EO15041 775 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGGTB-204ENST00000461653 BCAMP50895 628 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-204ENST00000461653 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-204ENST00000461653 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
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RABGGTB-204ENST00000461653 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-204ENST00000461653 TTC13Q8NBP0 860 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-204ENST00000461653 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-204ENST00000461653 NUTM2FA1L443 756 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-204ENST00000461653 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-204ENST00000461653 PTGDRQ13258 359 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-204ENST00000461653 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-204ENST00000461653 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-204ENST00000461653 WBP1LQ9NX94 342 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-204ENST00000461653 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-204ENST00000461653 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-204ENST00000461653 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTB-204ENST00000461653 FCHSD2O94868 740 aa11.1□□□□□ -0.63
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RABGGTB-204ENST00000461653 RNF40O75150 1001 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-204ENST00000461653 IFFO2Q5TF58 517 aa11.06□□□□□ -0.64
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RABGGTB-204ENST00000461653 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
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RABGGTB-204ENST00000461653 SLF2Q8IX21 1173 aa11.01□□□□□ -0.65
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RABGGTB-204ENST00000461653 SLC4A3P48751 1232 aa11.01□□□□□ -0.65
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RABGGTB-204ENST00000461653 GNPATO15228 680 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGGTB-204ENST00000461653 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A0G2JS52 829 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-204ENST00000461653 RCCD1A6NED2 376 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNC4Q03721 635 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-204ENST00000461653 FECHP22830 423 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM134Q9H6X4 195 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-204ENST00000461653 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-204ENST00000461653 OATP04181 439 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-204ENST00000461653 APLP1P51693 650 aa10.95□□□□□ -0.66
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