RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454356.5

MTA3-209, Transcript of metastasis associated 1 family member 3, human

TSL 5

Gene MTA3, Length 1,702 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTA3-209	ENST00000454356	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.7	■■■■■ 4.43
MTA3-209	ENST00000454356	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.67	■■■■■ 4.42
MTA3-209	ENST00000454356	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.67	■■■■■ 4.42
MTA3-209	ENST00000454356	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.63	■■■■■ 4.42
MTA3-209	ENST00000454356	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.63	■■■■■ 4.41
MTA3-209	ENST00000454356	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		42.6	■■■■■ 4.41
MTA3-209	ENST00000454356	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.6	■■■■■ 4.41
MTA3-209	ENST00000454356	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.6	■■■■■ 4.41
MTA3-209	ENST00000454356	ATP10A	O60312	1499 aa		42.58	■■■■■ 4.41
MTA3-209	ENST00000454356	A2M	P01023	1474 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MTA3-209	ENST00000454356	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.57	■■■■■ 4.4
MTA3-209	ENST00000454356	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.55	■■■■■ 4.4
MTA3-209	ENST00000454356	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.54	■■■■■ 4.4
MTA3-209	ENST00000454356	KIF3B	O15066	747 aa		42.53	■■■■■ 4.4
MTA3-209	ENST00000454356	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.53	■■■■■ 4.4
MTA3-209	ENST00000454356	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		42.52	■■■■■ 4.4
MTA3-209	ENST00000454356	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.5	■■■■■ 4.39
MTA3-209	ENST00000454356	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.5	■■■■■ 4.39
MTA3-209	ENST00000454356	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	42.49	■■■■■ 4.39
MTA3-209	ENST00000454356	KANK1	Q14678	1352 aa		42.47	■■■■■ 4.39
MTA3-209	ENST00000454356		E9PCH4	1651 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MTA3-209	ENST00000454356	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.45	■■■■■ 4.39
MTA3-209	ENST00000454356	TET3	O43151	1660 aa		42.45	■■■■■ 4.39
MTA3-209	ENST00000454356	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.45	■■■■■ 4.39
MTA3-209	ENST00000454356	MIER1	Q8N108	512 aa		42.45	■■■■■ 4.39
MTA3-209	ENST00000454356	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
MTA3-209	ENST00000454356	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.39	■■■■■ 4.38
MTA3-209	ENST00000454356	PTPRT	O14522	1441 aa		42.38	■■■■■ 4.37
MTA3-209	ENST00000454356	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.38	■■■■■ 4.37
MTA3-209	ENST00000454356	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
MTA3-209	ENST00000454356	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.35	■■■■■ 4.37
MTA3-209	ENST00000454356	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	42.34	■■■■■ 4.37
MTA3-209	ENST00000454356	TRPM2	O94759	1503 aa		42.34	■■■■■ 4.37
MTA3-209	ENST00000454356	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.32	■■■■■ 4.37
MTA3-209	ENST00000454356	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.29	■■■■■ 4.36
MTA3-209	ENST00000454356	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.28	■■■■■ 4.36
MTA3-209	ENST00000454356	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		42.27	■■■■■ 4.36
MTA3-209	ENST00000454356	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		42.27	■■■■■ 4.36
MTA3-209	ENST00000454356	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.26	■■■■■ 4.35
MTA3-209	ENST00000454356	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		42.25	■■■■■ 4.35
MTA3-209	ENST00000454356	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		42.25	■■■■■ 4.35
MTA3-209	ENST00000454356	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.24	■■■■■ 4.35
MTA3-209	ENST00000454356	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	42.23	■■■■■ 4.35
MTA3-209	ENST00000454356	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	42.21	■■■■■ 4.35
MTA3-209	ENST00000454356	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		42.19	■■■■■ 4.34
MTA3-209	ENST00000454356	CLTCL1	P53675	1640 aa		42.17	■■■■■ 4.34
MTA3-209	ENST00000454356	CEP152	O94986	1710 aa		42.16	■■■■■ 4.34
MTA3-209	ENST00000454356	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.16	■■■■■ 4.34
MTA3-209	ENST00000454356	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.16	■■■■■ 4.34
MTA3-209	ENST00000454356	ABCC3	O15438	1527 aa		42.13	■■■■■ 4.33
MTA3-209	ENST00000454356	GGT6	Q6P531	493 aa		42.12	■■■■■ 4.33
MTA3-209	ENST00000454356	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		42.09	■■■■■ 4.33
MTA3-209	ENST00000454356	USP47	Q96K76	1375 aa		42.07	■■■■■ 4.32
MTA3-209	ENST00000454356	NPAT	Q14207	1427 aa		42.05	■■■■■ 4.32
MTA3-209	ENST00000454356	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
MTA3-209	ENST00000454356	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.04	■■■■■ 4.32
MTA3-209	ENST00000454356	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		42.03	■■■■■ 4.32
MTA3-209	ENST00000454356	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	42	■■■■■ 4.31
MTA3-209	ENST00000454356	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42	■■■■■ 4.31
MTA3-209	ENST00000454356	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42	■■■■■ 4.31
MTA3-209	ENST00000454356	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		42	■■■■■ 4.31
MTA3-209	ENST00000454356	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		41.98	■■■■■ 4.31
MTA3-209	ENST00000454356	CCDC7	Q96M83	1385 aa		41.97	■■■■■ 4.31
MTA3-209	ENST00000454356	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		41.96	■■■■■ 4.31
MTA3-209	ENST00000454356	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		41.95	■■■■■ 4.31
MTA3-209	ENST00000454356	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	41.95	■■■■■ 4.31
MTA3-209	ENST00000454356	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	41.93	■■■■■ 4.3
MTA3-209	ENST00000454356	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		41.91	■■■■■ 4.3
MTA3-209	ENST00000454356	AGL	P35573	1532 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MTA3-209	ENST00000454356	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MTA3-209	ENST00000454356	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.88	■■■■■ 4.29
MTA3-209	ENST00000454356	NOS1	P29475	1434 aa		41.87	■■■■■ 4.29
MTA3-209	ENST00000454356	LAMC1	P11047	1609 aa		41.87	■■■■■ 4.29
MTA3-209	ENST00000454356	STAC3	Q96MF2	364 aa		41.86	■■■■■ 4.29
MTA3-209	ENST00000454356	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		41.86	■■■■■ 4.29
MTA3-209	ENST00000454356	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		41.85	■■■■■ 4.29
MTA3-209	ENST00000454356	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.85	■■■■■ 4.29
MTA3-209	ENST00000454356	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	41.84	■■■■■ 4.29
MTA3-209	ENST00000454356	ADGRB3	O60242	1522 aa		41.82	■■■■■ 4.28
MTA3-209	ENST00000454356	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.81	■■■■■ 4.28
MTA3-209	ENST00000454356	MROH2A	A6NES4	1674 aa		41.78	■■■■■ 4.28
MTA3-209	ENST00000454356	KIF1B	O60333	1816 aa		41.76	■■■■■ 4.28
MTA3-209	ENST00000454356	MYOM2	P54296	1465 aa		41.75	■■■■■ 4.27
MTA3-209	ENST00000454356	SYNM	O15061	1565 aa		41.75	■■■■■ 4.27
MTA3-209	ENST00000454356	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		41.74	■■■■■ 4.27
MTA3-209	ENST00000454356	PIK3C2B	O00750	1634 aa		41.72	■■■■■ 4.27
MTA3-209	ENST00000454356	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.71	■■■■■ 4.27
MTA3-209	ENST00000454356	IFT172	Q9UG01	1749 aa		41.69	■■■■■ 4.27
MTA3-209	ENST00000454356	ANP32C	O43423	234 aa		41.69	■■■■■ 4.27
MTA3-209	ENST00000454356	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.68	■■■■■ 4.26
MTA3-209	ENST00000454356	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	41.66	■■■■■ 4.26
MTA3-209	ENST00000454356	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		41.65	■■■■■ 4.26
MTA3-209	ENST00000454356	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		41.59	■■■■■ 4.25
MTA3-209	ENST00000454356	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		41.59	■■■■■ 4.25
MTA3-209	ENST00000454356	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		41.59	■■■■■ 4.25
MTA3-209	ENST00000454356	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	41.58	■■■■■ 4.25
MTA3-209	ENST00000454356	CCER2	I3L3R5	266 aa		41.57	■■■■■ 4.25
MTA3-209	ENST00000454356	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	41.55	■■■■■ 4.24
MTA3-209	ENST00000454356	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	41.55	■■■■■ 4.24
MTA3-209	ENST00000454356	IQGAP1	P46940	1657 aa		41.54	■■■■■ 4.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms