RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430356.3

PITRM1-AS1-201, PITRM1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PITRM1-AS1, Length 3,998 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ADGRL2O95490 1459 aa11.26□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ROCK1Q13464 1354 aa11.25□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.25□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.24□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCDC7Q96M83 1385 aa11.24□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11.23□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PDE4AP27815 886 aa11.22□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.22□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ABCC2Q92887 1545 aa11.22□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 USP35Q9P2H5 1018 aa11.21□□□□□ -0.61
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 EXOC6Q8TAG9 804 aa11.21□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.2□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.2□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.2□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.2□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.19□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.18□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.18□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SLC4A3P48751 1232 aa11.17□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GSE1Q14687 1217 aa11.17□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PLXNC1O60486 1568 aa11.17□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.16□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.16□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RCAN3Q9UKA8 241 aa11.15□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RRP1P56182 461 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PZPP20742 1482 aa11.15□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.15□□□□□ -0.62
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.15□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.14□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.13□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BACH2Q9BYV9 841 aa11.13□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.13□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ABCC5O15440 1437 aa11.13□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.12□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 UNC13BO14795 1591 aa11.12□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DAPK1P53355 1430 aa11.12□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NFKBIBQ15653 356 aa11.11□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IQGAP1P46940 1657 aa11.11□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.11□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SHANK2Q9UPX8 1470 aa11.11□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MYOM1P52179 1685 aa11.11□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ASXL2Q76L83 1435 aa11.11□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PLIN1O60240 522 aa11.1□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MS4A1P11836 297 aa11.1□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SKAP1Q86WV1 359 aa11.1□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.1□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.1□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.09□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TSPY4P0CV99 314 aa11.09□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TSPY10P0CW01 314 aa11.09□□□□□ -0.63
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.08□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.08□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.08□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARXQ96QS3 562 aa11.08□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa11.07□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa11.07□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.07□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.07□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.06□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.06□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 AFAP1Q8N556 730 aa11.06□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RGS3P49796 1198 aa11.05□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZMYM3Q14202 1370 aa11.05□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CRBNQ96SW2 442 aa11.05□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.05□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NLRP1Q9C000 1473 aa11.05□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.05□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.04□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PLCH2O75038 1416 aa11.04□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.04□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 USP47Q96K76 1375 aa11.04□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CDCA7LQ96GN5 454 aa11.04□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PREX2Q70Z35 1606 aa11.03□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.03□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.03□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.02□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IFT172Q9UG01 1749 aa11.02□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.02□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ATP10AO60312 1499 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms