RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429374.5

HDAC10-204, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HDAC10, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-204ENST00000429374 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.06■■□□□ 1.92
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HDAC10-204ENST00000429374 DIP2BQ9P265 1576 aa26.99■■□□□ 1.91
HDAC10-204ENST00000429374 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.99■■□□□ 1.91
HDAC10-204ENST00000429374 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.913e-7■■□□□ 14.4
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HDAC10-204ENST00000429374 A2MP01023 1474 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC10-204ENST00000429374 PLA2R1Q13018 1463 aa26.93■■□□□ 1.9
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.92■■□□□ 1.9
HDAC10-204ENST00000429374 RICTORQ6R327 1708 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC10-204ENST00000429374 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.91■■□□□ 1.9
HDAC10-204ENST00000429374 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
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HDAC10-204ENST00000429374 E9PCH4 1651 aa26.88■■□□□ 1.89
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HDAC10-204ENST00000429374 KIF3BO15066 747 aa26.87■■□□□ 1.89
HDAC10-204ENST00000429374 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.87■■□□□ 1.89
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HDAC10-204ENST00000429374 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.86■■□□□ 1.89
HDAC10-204ENST00000429374 PTPRTO14522 1441 aa26.85■■□□□ 1.89
HDAC10-204ENST00000429374 ABCA6Q8N139 1617 aa26.84■■□□□ 1.89
HDAC10-204ENST00000429374 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.83■■□□□ 1.89
HDAC10-204ENST00000429374 TRPM2O94759 1503 aa26.82■■□□□ 1.88
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HDAC10-204ENST00000429374 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
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HDAC10-204ENST00000429374 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.81■■□□□ 1.88
HDAC10-204ENST00000429374 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.78■■□□□ 1.88
HDAC10-204ENST00000429374 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.78■■□□□ 1.88
HDAC10-204ENST00000429374 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
HDAC10-204ENST00000429374 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.78■■□□□ 1.88
HDAC10-204ENST00000429374 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.78■■□□□ 1.88
HDAC10-204ENST00000429374 RAPGEF3O95398 923 aa26.76■■□□□ 1.87
HDAC10-204ENST00000429374 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.76■■□□□ 1.87
HDAC10-204ENST00000429374 STAC3Q96MF2 364 aa26.75■■□□□ 1.87
HDAC10-204ENST00000429374 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.74■■□□□ 1.87
HDAC10-204ENST00000429374 CEP152O94986 1710 aa26.73■■□□□ 1.87
HDAC10-204ENST00000429374 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.71■■□□□ 1.87
HDAC10-204ENST00000429374 TSPOAP1O95153 1857 aa26.7■■□□□ 1.87
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HDAC10-204ENST00000429374 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
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HDAC10-204ENST00000429374 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.68■■□□□ 1.86
HDAC10-204ENST00000429374 REREQ9P2R6 1566 aa26.67■■□□□ 1.86
HDAC10-204ENST00000429374 CLTCL1P53675 1640 aa26.66■■□□□ 1.86
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HDAC10-204ENST00000429374 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.61■■□□□ 1.85
HDAC10-204ENST00000429374 USP47Q96K76 1375 aa26.61■■□□□ 1.85
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HDAC10-204ENST00000429374 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.59■■□□□ 1.85
HDAC10-204ENST00000429374 KIF1BO60333 1816 aa26.59■■□□□ 1.85
HDAC10-204ENST00000429374 AGLP35573 1532 aa26.58■■□□□ 1.85
HDAC10-204ENST00000429374 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.58■■□□□ 1.84
HDAC10-204ENST00000429374 GGT6Q6P531 493 aa26.57■■□□□ 1.84
HDAC10-204ENST00000429374 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.57■■□□□ 1.84
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC7Q96M83 1385 aa26.57■■□□□ 1.84
HDAC10-204ENST00000429374 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.56■■□□□ 1.84
HDAC10-204ENST00000429374 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.56■■□□□ 1.84
HDAC10-204ENST00000429374 NPATQ14207 1427 aa26.56■■□□□ 1.84
HDAC10-204ENST00000429374 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.55■■□□□ 1.84
HDAC10-204ENST00000429374 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
HDAC10-204ENST00000429374 MADDQ8WXG6 1647 aa26.5■■□□□ 1.83
HDAC10-204ENST00000429374 NOS1P29475 1434 aa26.5■■□□□ 1.83
HDAC10-204ENST00000429374 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.49■■□□□ 1.83
HDAC10-204ENST00000429374 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HDAC10-204ENST00000429374 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HDAC10-204ENST00000429374 ANP32CO43423 234 aa26.47■■□□□ 1.83
HDAC10-204ENST00000429374 MYOM2P54296 1465 aa26.47■■□□□ 1.83
HDAC10-204ENST00000429374 IFT172Q9UG01 1749 aa26.47■■□□□ 1.83
HDAC10-204ENST00000429374 ADGRB3O60242 1522 aa26.46■■□□□ 1.83
HDAC10-204ENST00000429374 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.46■■□□□ 1.83
HDAC10-204ENST00000429374 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.46■■□□□ 1.83
HDAC10-204ENST00000429374 CCER2I3L3R5 266 aa26.45■■□□□ 1.82
HDAC10-204ENST00000429374 PIK3C2BO00750 1634 aa26.44■■□□□ 1.82
HDAC10-204ENST00000429374 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HDAC10-204ENST00000429374 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.42■■□□□ 1.82
HDAC10-204ENST00000429374 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.42■■□□□ 1.82
HDAC10-204ENST00000429374 MROH2AA6NES4 1674 aa26.4■■□□□ 1.82
HDAC10-204ENST00000429374 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.4■■□□□ 1.82
HDAC10-204ENST00000429374 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.39■■□□□ 1.82
HDAC10-204ENST00000429374 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
HDAC10-204ENST00000429374 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.38■■□□□ 1.81
HDAC10-204ENST00000429374 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.38■■□□□ 1.81
HDAC10-204ENST00000429374 SYNMO15061 1565 aa26.37■■□□□ 1.81
HDAC10-204ENST00000429374 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.36■■□□□ 1.81
HDAC10-204ENST00000429374 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.35■■□□□ 1.81
HDAC10-204ENST00000429374 IQGAP1P46940 1657 aa26.34■■□□□ 1.81
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