RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.42■■□□□ 1.82
TTLL3-210ENST00000427220 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.42■■□□□ 1.82
TTLL3-210ENST00000427220 GGT6Q6P531 493 aa26.41■■□□□ 1.82
TTLL3-210ENST00000427220 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.41■■□□□ 1.82
TTLL3-210ENST00000427220 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.41■■□□□ 1.82
TTLL3-210ENST00000427220 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.4■■□□□ 1.82
TTLL3-210ENST00000427220 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.4■■□□□ 1.82
TTLL3-210ENST00000427220 NUDCQ9Y266 331 aa26.4■■□□□ 1.82
TTLL3-210ENST00000427220 CHD1O14646 1710 aa26.38■■□□□ 1.81
TTLL3-210ENST00000427220 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.38■■□□□ 1.81
TTLL3-210ENST00000427220 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.37■■□□□ 1.81
TTLL3-210ENST00000427220 PLIN1O60240 522 aa26.37■■□□□ 1.81
TTLL3-210ENST00000427220 TMF1P82094 1093 aa26.37■■□□□ 1.81
TTLL3-210ENST00000427220 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
TTLL3-210ENST00000427220 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.36■■□□□ 1.81
TTLL3-210ENST00000427220 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
TTLL3-210ENST00000427220 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
TTLL3-210ENST00000427220 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.33■■□□□ 1.81
TTLL3-210ENST00000427220 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
TTLL3-210ENST00000427220 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.31■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.3■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.3■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.3■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 RALBP1Q15311 655 aa26.3■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.3■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.29■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 PLA2R1Q13018 1463 aa26.29■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.29■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 NLRP13Q86W25 1043 aa26.29■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 TESK2Q96S53 571 aa26.27■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.27■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.26■■□□□ 1.8
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.26■■□□□ 1.79
TTLL3-210ENST00000427220 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.26■■□□□ 1.79
TTLL3-210ENST00000427220 MSH5O43196 834 aa26.25■■□□□ 1.79
TTLL3-210ENST00000427220 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.25■■□□□ 1.79
TTLL3-210ENST00000427220 KDM5CP41229 1560 aa26.24■■□□□ 1.79
TTLL3-210ENST00000427220 SKAP1Q86WV1 359 aa26.24■■□□□ 1.79
TTLL3-210ENST00000427220 A2MP01023 1474 aa26.24■■□□□ 1.79
TTLL3-210ENST00000427220 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.22■■□□□ 1.79
TTLL3-210ENST00000427220 PLCH2O75038 1416 aa26.21■■□□□ 1.79
TTLL3-210ENST00000427220 ABCC2Q92887 1545 aa26.2■■□□□ 1.79
TTLL3-210ENST00000427220 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
TTLL3-210ENST00000427220 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.2■■□□□ 1.78
TTLL3-210ENST00000427220 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.2■■□□□ 1.78
TTLL3-210ENST00000427220 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
TTLL3-210ENST00000427220 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.19■■□□□ 1.78
TTLL3-210ENST00000427220 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.19■■□□□ 1.78
TTLL3-210ENST00000427220 NEUROD2Q15784 382 aa26.18■■□□□ 1.78
TTLL3-210ENST00000427220 ERBINQ96RT1 1412 aa26.16■■□□□ 1.78
TTLL3-210ENST00000427220 RAPGEF3O95398 923 aa26.16■■□□□ 1.78
TTLL3-210ENST00000427220 PREX2Q70Z35 1606 aa26.15■■□□□ 1.78
TTLL3-210ENST00000427220 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.14■■□□□ 1.78
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.13■■□□□ 1.77
TTLL3-210ENST00000427220 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
TTLL3-210ENST00000427220 KANK1Q14678 1352 aa26.12■■□□□ 1.77
TTLL3-210ENST00000427220 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TTLL3-210ENST00000427220 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TTLL3-210ENST00000427220 STK26Q9P289 416 aa26.09■■□□□ 1.77
TTLL3-210ENST00000427220 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.08■■□□□ 1.76
TTLL3-210ENST00000427220 NBR1Q14596 966 aa26.07■■□□□ 1.76
TTLL3-210ENST00000427220 FANCAO15360 1455 aa26.06■■□□□ 1.76
TTLL3-210ENST00000427220 PPP2R1AP30153 589 aa26.05■■□□□ 1.76
TTLL3-210ENST00000427220 OSCARQ8IYS5 282 aa26.04■■□□□ 1.76
TTLL3-210ENST00000427220 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.04■■□□□ 1.76
TTLL3-210ENST00000427220 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.03■■□□□ 1.76
TTLL3-210ENST00000427220 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.02■■□□□ 1.76
TTLL3-210ENST00000427220 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.02■■□□□ 1.76
TTLL3-210ENST00000427220 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.01■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 ADGRL1O94910 1474 aa26.01■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 MYT1Q01538 1121 aa26■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 CRBNQ96SW2 442 aa25.99■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.99■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 APAF1O14727 1248 aa25.98■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 MLECQ14165 292 aa25.97■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.97■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 ASXL2Q76L83 1435 aa25.96■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.96■■□□□ 1.75
TTLL3-210ENST00000427220 CDCA8Q53HL2 280 aa25.95■■□□□ 1.74
TTLL3-210ENST00000427220 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TTLL3-210ENST00000427220 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TTLL3-210ENST00000427220 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TTLL3-210ENST00000427220 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.92■■□□□ 1.74
TTLL3-210ENST00000427220 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
TTLL3-210ENST00000427220 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.89■■□□□ 1.74
TTLL3-210ENST00000427220 ATP10AO60312 1499 aa25.89■■□□□ 1.74
TTLL3-210ENST00000427220 ABCC1P33527 1531 aa25.89■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.89■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.88■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 MORC1Q86VD1 984 aa25.88■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms