RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 PTGER2P43116 358 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 KCNH8Q96L42 1107 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 MAP3K7O43318 606 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 PROX2Q3B8N5 592 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 FBXW7Q969H0 707 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 EPAS1Q99814 870 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 SEMA3EO15041 775 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 HRO43593 1189 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 P3H3Q8IVL6 736 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 TK2O00142 265 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 OSBPP22059 807 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-208ENST00000427110 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-208ENST00000427110 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-208ENST00000427110 STAC3Q96MF2 364 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-208ENST00000427110 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-208ENST00000427110 SLC4A5Q9BY07 1137 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-208ENST00000427110 KIAA1468Q9P260 1216 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-208ENST00000427110 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-208ENST00000427110 C3orf80F5H4A9 247 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-208ENST00000427110 FAM198AQ9UFP1 575 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-208ENST00000427110 TSKSQ9UJT2 592 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-208ENST00000427110 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-208ENST00000427110 NUTM2FA1L443 756 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 SMAPO00193 183 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 CDCA7LQ96GN5 454 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 RABGEF1Q9UJ41 708 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 GOLGA8CPA6NN73 597 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 PRSS12P56730 875 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 NBPF3Q9H094 633 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 PTPN5P54829 565 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 PADI6Q6TGC4 694 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 WNT2BQ93097 391 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 BCAMP50895 628 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 FAM161AQ3B820 660 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 THSD4Q6ZMP0 1018 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 PACS2Q86VP3 889 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 PNMA3Q9UL41 463 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 PTGDRQ13258 359 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 NUDT18Q6ZVK8 323 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 CERKQ8TCT0 537 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 ANKK1Q8NFD2 765 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 TATDN2Q93075 761 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 HCSTQ9UBK5 93 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-208ENST00000427110 NBPF26B4DH59 902 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 LAPTM4BQ86VI4 370 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 FECHP22830 423 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 TTC13Q8NBP0 860 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 SOWAHBA6NEL2 793 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 GPR37O15354 613 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 FCHSD2O94868 740 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 SMYD5Q6GMV2 418 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 SAMD7Q7Z3H4 446 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 RNF40O75150 1001 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 GPIHBP1Q8IV16 184 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 WBP1LQ9NX94 342 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 LRCH3Q96II8 777 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 EYA1Q99502 592 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 HPS5Q9UPZ3 1129 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 ADGRG1Q9Y653 693 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 NLRP7Q8WX94 980 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-208ENST00000427110 GNPATO15228 680 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 HIC1Q14526 733 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 RCCD1A6NED2 376 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 PPP4CP60510 307 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 LMOD2Q6P5Q4 547 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 DNAJB2P25686 324 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 PHOX2BQ99453 314 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 APLP1P51693 650 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 HDGFP51858 240 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM134Q9H6X4 195 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-208ENST00000427110 OATP04181 439 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-208ENST00000427110 SLF2Q8IX21 1173 aa5.76□□□□□ -1.49
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