RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422596.1

TRDN-203, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 3

Gene TRDN, Length 776 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-203ENST00000422596 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRDN-203ENST00000422596 COL9A1P20849 921 aa9.62□□□□□ -0.87
TRDN-203ENST00000422596 DDX12PQ92771 950 aa9.62□□□□□ -0.87
TRDN-203ENST00000422596 E2F4Q16254 413 aa9.6□□□□□ -0.87
TRDN-203ENST00000422596 FBXW7Q969H0 707 aa9.6□□□□□ -0.87
TRDN-203ENST00000422596 HCSTQ9UBK5 93 aa9.6□□□□□ -0.87
TRDN-203ENST00000422596 PROX2Q3B8N5 592 aa9.59□□□□□ -0.87
TRDN-203ENST00000422596 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.58□□□□□ -0.88
TRDN-203ENST00000422596 PDIA6Q15084 440 aa9.58□□□□□ -0.88
TRDN-203ENST00000422596 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRDN-203ENST00000422596 WDR70Q9NW82 654 aa9.58□□□□□ -0.88
TRDN-203ENST00000422596 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.57□□□□□ -0.88
TRDN-203ENST00000422596 EPAS1Q99814 870 aa9.57□□□□□ -0.88
TRDN-203ENST00000422596 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRDN-203ENST00000422596 PTPN5P54829 565 aa9.54□□□□□ -0.88
TRDN-203ENST00000422596 NBR1Q14596 966 aa9.54□□□□□ -0.88
TRDN-203ENST00000422596 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRDN-203ENST00000422596 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 WNT2BQ93097 391 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 NBPF3Q9H094 633 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.5□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 MAP3K7O43318 606 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDN-203ENST00000422596 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 OSBPP22059 807 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 TSKSQ9UJT2 592 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 BCAMP50895 628 aa9.43□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.41□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.41□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 P3H3Q8IVL6 736 aa9.4□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.4□□□□□ -0.9
TRDN-203ENST00000422596 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.39□□□□□ -0.91
TRDN-203ENST00000422596 C3orf80F5H4A9 247 aa9.39□□□□□ -0.91
TRDN-203ENST00000422596 SMAPO00193 183 aa9.38□□□□□ -0.91
TRDN-203ENST00000422596 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TRDN-203ENST00000422596 PRSS12P56730 875 aa9.38□□□□□ -0.91
TRDN-203ENST00000422596 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TRDN-203ENST00000422596 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TRDN-203ENST00000422596 BCANQ96GW7 911 aa9.38□□□□□ -0.91
TRDN-203ENST00000422596 PACS2Q86VP3 889 aa9.37□□□□□ -0.91
TRDN-203ENST00000422596 CERKQ8TCT0 537 aa9.35□□□□□ -0.91
TRDN-203ENST00000422596 WBP1LQ9NX94 342 aa9.35□□□□□ -0.91
TRDN-203ENST00000422596 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TRDN-203ENST00000422596 TATDN2Q93075 761 aa9.32□□□□□ -0.92
TRDN-203ENST00000422596 LRCH3Q96II8 777 aa9.32□□□□□ -0.92
TRDN-203ENST00000422596 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TRDN-203ENST00000422596 PNMA3Q9UL41 463 aa9.31□□□□□ -0.92
TRDN-203ENST00000422596 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.31□□□□□ -0.92
TRDN-203ENST00000422596 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.3□□□□□ -0.92
TRDN-203ENST00000422596 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TRDN-203ENST00000422596 IFFO2Q5TF58 517 aa9.29□□□□□ -0.92
TRDN-203ENST00000422596 PADI6Q6TGC4 694 aa9.29□□□□□ -0.92
TRDN-203ENST00000422596 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.29□□□□□ -0.92
TRDN-203ENST00000422596 TTC13Q8NBP0 860 aa9.29□□□□□ -0.92
TRDN-203ENST00000422596 NBPF26B4DH59 902 aa9.28□□□□□ -0.92
TRDN-203ENST00000422596 SEMA3EO15041 775 aa9.27□□□□□ -0.93
TRDN-203ENST00000422596 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRDN-203ENST00000422596 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRDN-203ENST00000422596 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.26□□□□□ -0.93
TRDN-203ENST00000422596 A0A0G2JS52 829 aa9.25□□□□□ -0.93
TRDN-203ENST00000422596 PPP4CP60510 307 aa9.25□□□□□ -0.93
TRDN-203ENST00000422596 PTGDRQ13258 359 aa9.23□□□□□ -0.93
TRDN-203ENST00000422596 EYA1Q99502 592 aa9.21□□□□□ -0.94
TRDN-203ENST00000422596 NUTM2FA1L443 756 aa9.2□□□□□ -0.94
TRDN-203ENST00000422596 RNF40O75150 1001 aa9.2□□□□□ -0.94
TRDN-203ENST00000422596 KCNC4Q03721 635 aa9.2□□□□□ -0.94
TRDN-203ENST00000422596 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TRDN-203ENST00000422596 FAM161AQ3B820 660 aa9.18□□□□□ -0.94
TRDN-203ENST00000422596 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
TRDN-203ENST00000422596 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TRDN-203ENST00000422596 APLP1P51693 650 aa9.16□□□□□ -0.94
TRDN-203ENST00000422596 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.16□□□□□ -0.94
TRDN-203ENST00000422596 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TRDN-203ENST00000422596 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.15□□□□□ -0.94
TRDN-203ENST00000422596 RGS20O76081 388 aa9.14□□□□□ -0.95
TRDN-203ENST00000422596 MTRQ99707 1265 aa9.14□□□□□ -0.95
TRDN-203ENST00000422596 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TRDN-203ENST00000422596 FCHSD2O94868 740 aa9.13□□□□□ -0.95
TRDN-203ENST00000422596 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.13□□□□□ -0.95
TRDN-203ENST00000422596 SLF2Q8IX21 1173 aa9.12□□□□□ -0.95
TRDN-203ENST00000422596 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TRDN-203ENST00000422596 ZNF516Q92618 1163 aa9.11□□□□□ -0.95
TRDN-203ENST00000422596 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
TRDN-203ENST00000422596 RCCD1A6NED2 376 aa9.09□□□□□ -0.95
TRDN-203ENST00000422596 DNAJB2P25686 324 aa9.09□□□□□ -0.95
TRDN-203ENST00000422596 IL21Q9HBE4 155 aa9.09□□□□□ -0.95
TRDN-203ENST00000422596 FECHP22830 423 aa9.08□□□□□ -0.96
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