RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC37Q6PGP7 1564 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 MRS2Q9HD23 443 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 IQGAP3Q86VI3 1631 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRTO14522 1441 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF15Q9NS87 1388 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDCQ9Y266 331 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC141Q6ZP82 1450 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 MROH1Q8NDA8 1641 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ERCC6L2Q5T890 1561 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 NEURL4Q96JN8 1562 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 DISP3Q9P2K9 1392 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 JPH4Q96JJ6 628 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC2Q92887 1545 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 DUOX2Q9NRD8 1548 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 NBPF1Q3BBV0 1214 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 NUP155O75694 1391 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 MYOM1P52179 1685 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 MADDQ8WXG6 1647 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 CLASP1Q7Z460 1538 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM2BQ8NHM5 1336 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 IQGAP1P46940 1657 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 NRXN1Q9ULB1 1477 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 SYCP2Q9BX26 1530 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ARAP3Q8WWN8 1544 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 DEPDC5O75140 1603 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAPERQ9BY12 1400 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ARID3CA6NKF2 412 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM9BQ8IZU0 186 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ERCC6Q03468 1493 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC1P33527 1531 aa4.96□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 NLRP13Q86W25 1043 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 NLRP1Q9C000 1473 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPM2O94759 1503 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 CDCA7LQ96GN5 454 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 BACH2Q9BYV9 841 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRB1O14514 1584 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 USP19O94966 1318 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 NEFLP07196 543 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 ERBINQ96RT1 1412 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3C2GO75747 1445 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVK-7P63135 1459 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 PLCH2O75038 1416 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 RALBP1Q15311 655 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOC6Q8TAG9 804 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 DMRT2Q9Y5R5 561 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC144AA2RUR9 1427 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE3BQ13370 1112 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 SKAP1Q86WV1 359 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 CLTCL1P53675 1640 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 RSPH4AQ5TD94 716 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNMO15061 1565 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 MYOM2P54296 1465 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 LMTK2Q8IWU2 1503 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO3AQ8NEV4 1616 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A1P11836 297 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 IQSEC2Q5JU85 1478 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 DCAF11Q8TEB1 546 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 IFT172Q9UG01 1749 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 SHPRHQ149N8 1683 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHD1A6NEE1 506 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 C8orf34Q49A92 452 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO5CQ9NQX4 1742 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCA9Q8IUA7 1624 aa4.9□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 CARD14Q9BXL6 1004 aa4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms