RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 VGFO15240 615 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 SOX12O15370 315 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 POGZQ7Z3K3 1410 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 UACAQ9BZF9 1416 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 YEATS2Q9ULM3 1422 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 TTC37Q6PGP7 1564 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 KDM5BQ9UGL1 1544 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXD1Q16676 465 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 CUL7Q14999 1698 aa5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 MYOM3Q5VTT5 1437 aa5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 RAPGEF3O95398 923 aa5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 NPHP1O15259 732 aa5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 DDRGK1Q96HY6 314 aa5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 MRS2Q9HD23 443 aa5.74□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGAP5Q13017 1502 aa5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 STRCQ7RTU9 1775 aa5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA6L22H0YM25 854 aa5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 NUTM2FA1L443 756 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 CD109Q6YHK3 1445 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF15Q9NS87 1388 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 ATF3P18847 181 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 FKBP8Q14318 412 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.72□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC144AA2RUR9 1427 aa5.71□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 SCAPERQ9BY12 1400 aa5.71□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 TERF2IPQ9NYB0 399 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 TXNDC2Q86VQ3 553 aa5.71□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 BECN1Q14457 450 aa5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 MORC1Q86VD1 984 aa5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAK1Q9UPV9 953 aa5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 PTMAP06454 111 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 PRXQ9BXM0 1461 aa5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR7Q9Y4E6 1490 aa5.7□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 EFCAB5A4FU69 1503 aa5.69□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKLE2Q86XL3 938 aa5.69□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 IQGAP2Q13576 1575 aa5.69□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 FANCAO15360 1455 aa5.69□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 NEO1Q92859 1461 aa5.68□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 EVA1CP58658 441 aa5.68□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 NEUROD2Q15784 382 aa5.68□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.68□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 NRDCO43847 1150 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC136Q96JN2 1154 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 PSME1Q06323 249 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 STAC3Q96MF2 364 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 AMPHP49418 695 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC52A1Q9NWF4 448 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 FGD6Q6ZV73 1430 aa5.67□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 NCOA2Q15596 1464 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 EVC2Q86UK5 1308 aa5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.65□□□□□ -1.5
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa5.65□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
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