RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405675.7

CSNK1E-205, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 2,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-205ENST00000405675 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.19
CSNK1E-205ENST00000405675 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.191e-6■■■□□ 14.6
CSNK1E-205ENST00000405675 UNC13BO14795 1591 aa41.22■■■■■ 4.19
CSNK1E-205ENST00000405675 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.21■■■■■ 4.19
CSNK1E-205ENST00000405675 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.18■■■■■ 4.18
CSNK1E-205ENST00000405675 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.16■■■■■ 4.18
CSNK1E-205ENST00000405675 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
CSNK1E-205ENST00000405675 RICTORQ6R327 1708 aa41.15■■■■■ 4.18
CSNK1E-205ENST00000405675 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.14■■■■■ 4.18
CSNK1E-205ENST00000405675 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.12■■■■■ 4.17
CSNK1E-205ENST00000405675 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.11■■■■■ 4.17
CSNK1E-205ENST00000405675 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
CSNK1E-205ENST00000405675 KIF3BO15066 747 aa41.06■■■■■ 4.16
CSNK1E-205ENST00000405675 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.06■■■■■ 4.16
CSNK1E-205ENST00000405675 A2MP01023 1474 aa41.06■■■■■ 4.16
CSNK1E-205ENST00000405675 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.06■■■■■ 4.16
CSNK1E-205ENST00000405675 ABCA6Q8N139 1617 aa41.04■■■■■ 4.16
CSNK1E-205ENST00000405675 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
CSNK1E-205ENST00000405675 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
CSNK1E-205ENST00000405675 DEPDC5O75140 1603 aa40.99■■■■■ 4.15
CSNK1E-205ENST00000405675 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
CSNK1E-205ENST00000405675 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.96■■■■■ 4.15
CSNK1E-205ENST00000405675 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.95■■■■■ 4.15
CSNK1E-205ENST00000405675 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.14
CSNK1E-205ENST00000405675 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.91■■■■■ 4.14
CSNK1E-205ENST00000405675 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
CSNK1E-205ENST00000405675 PLA2R1Q13018 1463 aa40.9■■■■■ 4.14
CSNK1E-205ENST00000405675 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.89■■■■■ 4.14
CSNK1E-205ENST00000405675 KANK1Q14678 1352 aa40.87■■■■■ 4.13
CSNK1E-205ENST00000405675 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
CSNK1E-205ENST00000405675 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.85■■■■■ 4.13
CSNK1E-205ENST00000405675 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
CSNK1E-205ENST00000405675 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.12
CSNK1E-205ENST00000405675 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
CSNK1E-205ENST00000405675 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
CSNK1E-205ENST00000405675 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.79■■■■■ 4.12
CSNK1E-205ENST00000405675 GGT6Q6P531 493 aa40.79■■■■■ 4.12
CSNK1E-205ENST00000405675 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.78■■■■■ 4.12
CSNK1E-205ENST00000405675 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.76■■■■■ 4.12
CSNK1E-205ENST00000405675 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.76■■■■■ 4.12
CSNK1E-205ENST00000405675 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.76■■■■■ 4.12
CSNK1E-205ENST00000405675 E9PCH4 1651 aa40.75■■■■■ 4.11
CSNK1E-205ENST00000405675 TET3O43151 1660 aa40.74■■■■■ 4.11
CSNK1E-205ENST00000405675 ATP10AO60312 1499 aa40.71■■■■■ 4.11
CSNK1E-205ENST00000405675 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.69■■■■■ 4.1
CSNK1E-205ENST00000405675 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.69■■■■■ 4.1
CSNK1E-205ENST00000405675 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
CSNK1E-205ENST00000405675 RALGAPBQ86X10 1494 aa40.65■■■■■ 4.1
CSNK1E-205ENST00000405675 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.64■■■■■ 4.1
CSNK1E-205ENST00000405675 CEP152O94986 1710 aa40.64■■■■■ 4.1
CSNK1E-205ENST00000405675 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.61■■■■■ 4.09
CSNK1E-205ENST00000405675 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.6■■■■■ 4.09
CSNK1E-205ENST00000405675 RGL3Q3MIN7 710 aa40.59■■■■■ 4.09
CSNK1E-205ENST00000405675 USP47Q96K76 1375 aa40.58■■■■■ 4.09
CSNK1E-205ENST00000405675 CCDC7Q96M83 1385 aa40.58■■■■■ 4.09
CSNK1E-205ENST00000405675 PTPRTO14522 1441 aa40.58■■■■■ 4.09
CSNK1E-205ENST00000405675 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
CSNK1E-205ENST00000405675 REREQ9P2R6 1566 aa40.56■■■■■ 4.08
CSNK1E-205ENST00000405675 ABCC3O15438 1527 aa40.56■■■■■ 4.08
CSNK1E-205ENST00000405675 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.54■■■■■ 4.08
CSNK1E-205ENST00000405675 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.54■■■■■ 4.08
CSNK1E-205ENST00000405675 ANP32CO43423 234 aa40.54■■■■■ 4.08
CSNK1E-205ENST00000405675 TRPM2O94759 1503 aa40.53■■■■■ 4.08
CSNK1E-205ENST00000405675 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.5■■■■■ 4.07
CSNK1E-205ENST00000405675 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.49■■■■■ 4.07
CSNK1E-205ENST00000405675 AGLP35573 1532 aa40.49■■■■■ 4.07
CSNK1E-205ENST00000405675 CARD11Q9BXL7 1154 aa40.48■■■■■ 4.07
CSNK1E-205ENST00000405675 KIF7Q2M1P5 1343 aa40.47■■■■■ 4.07
CSNK1E-205ENST00000405675 NPATQ14207 1427 aa40.47■■■■■ 4.07
CSNK1E-205ENST00000405675 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
CSNK1E-205ENST00000405675 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.43■■■■■ 4.06
CSNK1E-205ENST00000405675 CLTCL1P53675 1640 aa40.43■■■■■ 4.06
CSNK1E-205ENST00000405675 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.43■■■■■ 4.06
CSNK1E-205ENST00000405675 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa40.41■■■■■ 4.06
CSNK1E-205ENST00000405675 CCER2I3L3R5 266 aa40.39■■■■■ 4.06
CSNK1E-205ENST00000405675 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
CSNK1E-205ENST00000405675 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.06
CSNK1E-205ENST00000405675 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.37■■■■■ 4.05
CSNK1E-205ENST00000405675 MLECQ14165 292 aa40.36■■■■■ 4.05
CSNK1E-205ENST00000405675 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
CSNK1E-205ENST00000405675 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.31■■■■■ 4.04
CSNK1E-205ENST00000405675 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.31■■■■■ 4.04
CSNK1E-205ENST00000405675 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.29■■■■■ 4.04
CSNK1E-205ENST00000405675 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.27■■■■■ 4.04
CSNK1E-205ENST00000405675 GPRASP1Q5JY77 1395 aa40.27■■■■■ 4.04
CSNK1E-205ENST00000405675 NOS1P29475 1434 aa40.25■■■■■ 4.03
CSNK1E-205ENST00000405675 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
CSNK1E-205ENST00000405675 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa40.22■■■■■ 4.03
CSNK1E-205ENST00000405675 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
CSNK1E-205ENST00000405675 LAMC1P11047 1609 aa40.18■■■■■ 4.02
CSNK1E-205ENST00000405675 POLR3GLQ9BT43 218 aa40.17■■■■■ 4.02
CSNK1E-205ENST00000405675 MADDQ8WXG6 1647 aa40.17■■■■■ 4.02
CSNK1E-205ENST00000405675 SYNMO15061 1565 aa40.16■■■■■ 4.02
CSNK1E-205ENST00000405675 KIF1BO60333 1816 aa40.16■■■■■ 4.02
CSNK1E-205ENST00000405675 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.15■■■■■ 4.02
CSNK1E-205ENST00000405675 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
CSNK1E-205ENST00000405675 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
CSNK1E-205ENST00000405675 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.1■■■■■ 4.01
CSNK1E-205ENST00000405675 MROH2AA6NES4 1674 aa40.1■■■■■ 4.01
CSNK1E-205ENST00000405675 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
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