RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391208.1

RNU6-972P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 972, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-972P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-972P-201ENST00000391208 TBC1D12O60347 775 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-972P-201ENST00000391208 GDF11O95390 407 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 TRIM67Q6ZTA4 783 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 CRIPAKQ8N1N5 446 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 TMC2Q8TDI7 906 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 RABGEF1Q9UJ41 708 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 TMUB1Q9BVT8 246 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 LCE2CQ5TA81 110 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 MS4A4AQ96JQ5 239 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 IL21Q9HBE4 155 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 TJAP1Q5JTD0 557 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZNF454Q8N9F8 522 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 IRF7Q92985 503 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-972P-201ENST00000391208 AXIN1O15169 862 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 SLC19A1P41440 591 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 FOXK2Q01167 660 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 RASSF7Q02833 373 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 CTC1Q2NKJ3 1217 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 GMPRP36959 345 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 GPAT2Q6NUI2 795 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 HPS5Q9UPZ3 1129 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 LRCH3Q96II8 777 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 SENP2Q9HC62 589 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 GSK3AP49840 483 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 PHF8Q9UPP1 1060 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 ADAM23O75077 832 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 NLRP6P59044 892 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 SPRYD7Q5W111 196 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 MTRQ99707 1265 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-972P-201ENST00000391208 PPP4CP60510 307 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 DACH1Q9UI36 760 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 AVPP01185 164 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 Q8N3U1 123 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 KIFC2Q96AC6 838 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 TNFRSF10AO00220 468 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZNF697Q5TEC3 545 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 LMOD2Q6P5Q4 547 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 GDF9O60383 454 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 TRIM47Q96LD4 638 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 FOSBP53539 338 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-972P-201ENST00000391208 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-972P-201ENST00000391208 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-972P-201ENST00000391208 KLHL34Q8N239 644 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-972P-201ENST00000391208 LCE1DQ5T752 114 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZDHHC16Q969W1 377 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-972P-201ENST00000391208 JPH4Q96JJ6 628 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-972P-201ENST00000391208 KIAA1468Q9P260 1216 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-972P-201ENST00000391208 PROX2Q3B8N5 592 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZNF516Q92618 1163 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-972P-201ENST00000391208 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-972P-201ENST00000391208 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 KANK3Q6NY19 840 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 ANKLE1Q8NAG6 615 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 NKX2-3Q8TAU0 364 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 ADAM33Q9BZ11 813 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 RNF223E7ERA6 249 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 H3BM21 787 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 MSTNO14793 375 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 FOXK1P85037 733 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 PLPP6Q8IY26 295 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 CYP4X1Q8N118 509 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 FBXO22Q8NEZ5 403 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 TRIM41Q8WV44 630 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 NECTIN2Q92692 538 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 COBLO75128 1261 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-972P-201ENST00000391208 FOXC1Q12948 553 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-972P-201ENST00000391208 LIAT1Q6ZQX7 453 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-972P-201ENST00000391208 TOR4AQ9NXH8 423 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-972P-201ENST00000391208 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-972P-201ENST00000391208 ERBB4Q15303 1308 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZPR1O75312 459 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-972P-201ENST00000391208 IRS1P35568 1242 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-972P-201ENST00000391208 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-972P-201ENST00000391208 GALNT6Q8NCL4 622 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-972P-201ENST00000391208 OXER1Q8TDS5 423 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms