RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRN2-201ENST00000389413 USP35Q9P2H5 1018 aa20.47■□□□□ 0.87
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PTPRN2-201ENST00000389413 GSE1Q14687 1217 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTPRN2-201ENST00000389413 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.24■□□□□ 0.83
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PTPRN2-201ENST00000389413 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.19■□□□□ 0.82
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PTPRN2-201ENST00000389413 MAPKBP1O60336 1514 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTPRN2-201ENST00000389413 STK31Q9BXU1 1019 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRN2-201ENST00000389413 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRN2-201ENST00000389413 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRN2-201ENST00000389413 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRN2-201ENST00000389413 AAMPQ13685 434 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRN2-201ENST00000389413 ABCC5O15440 1437 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRN2-201ENST00000389413 FGD1P98174 961 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRN2-201ENST00000389413 AFAP1Q8N556 730 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTPRN2-201ENST00000389413 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.14■□□□□ 0.81
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