RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 GBP4Q96PP9 640 aa22.04■■□□□ 1.12
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PTPRU-202ENST00000373779 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.93■■□□□ 1.1
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PTPRU-202ENST00000373779 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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PTPRU-202ENST00000373779 PANK1Q8TE04 598 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 FGD1P98174 961 aa21.72■■□□□ 1.07
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PTPRU-202ENST00000373779 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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PTPRU-202ENST00000373779 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.7■■□□□ 1.06
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