RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365415.1

RNU6-117P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 117, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-117P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-117P-201ENST00000365415 MMRN1Q13201 1228 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-117P-201ENST00000365415 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-117P-201ENST00000365415 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-117P-201ENST00000365415 FBXW7Q969H0 707 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-117P-201ENST00000365415 MYT1LQ9UL68 1186 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-117P-201ENST00000365415 SEMA3EO15041 775 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-117P-201ENST00000365415 COL9A1P20849 921 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-117P-201ENST00000365415 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-117P-201ENST00000365415 PROX2Q3B8N5 592 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-117P-201ENST00000365415 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-117P-201ENST00000365415 VSIG10Q8N0Z9 540 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-117P-201ENST00000365415 GOLGA8CPA6NN73 597 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 PTGER2P43116 358 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 ZBED2Q9BTP6 218 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 CDHR5Q9HBB8 845 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 NUTM2FA1L443 756 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 OSBPP22059 807 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 TK2O00142 265 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 NBPF3Q9H094 633 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 KIAA1468Q9P260 1216 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 SMAPO00193 183 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 PTPN5P54829 565 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-117P-201ENST00000365415 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 HRO43593 1189 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 WNT2BQ93097 391 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 CDCA7LQ96GN5 454 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 RNF40O75150 1001 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 PRSS12P56730 875 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 PACS2Q86VP3 889 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 SLC4A5Q9BY07 1137 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 RABGEF1Q9UJ41 708 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 TSKSQ9UJT2 592 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 PNMA3Q9UL41 463 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 PADI6Q6TGC4 694 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 CERKQ8TCT0 537 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 NBPF26B4DH59 902 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 BCAMP50895 628 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 FAM161AQ3B820 660 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 ANKK1Q8NFD2 765 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 FAM198AQ9UFP1 575 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 SLC24A1O60721 1099 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 FCHSD2O94868 740 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 TATDN2Q93075 761 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 C3orf80F5H4A9 247 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 PTGDRQ13258 359 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 THSD4Q6ZMP0 1018 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 HCSTQ9UBK5 93 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 HDGFP51858 240 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 SAMD7Q7Z3H4 446 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 LRCH3Q96II8 777 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-117P-201ENST00000365415 HPS5Q9UPZ3 1129 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 SOWAHBA6NEL2 793 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 FECHP22830 423 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 HIC1Q14526 733 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 GNPATO15228 680 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 PPP4CP60510 307 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 WBP1LQ9NX94 342 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 LMOD2Q6P5Q4 547 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 NLRP7Q8WX94 980 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 ADGRG1Q9Y653 693 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 RCCD1A6NED2 376 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 SLC4A3P48751 1232 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 TTC13Q8NBP0 860 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 GPR37O15354 613 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 DNAJB2P25686 324 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 EYA1Q99502 592 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-117P-201ENST00000365415 OATP04181 439 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-117P-201ENST00000365415 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-117P-201ENST00000365415 SLF2Q8IX21 1173 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-117P-201ENST00000365415 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-117P-201ENST00000365415 PXYLP1Q8TE99 480 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-117P-201ENST00000365415 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms