RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361357.7

MAP3K3-201, Transcript of mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MAP3K3, Length 4,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K3-201ENST00000361357 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
MAP3K3-201ENST00000361357 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.6■■□□□ 1.69
MAP3K3-201ENST00000361357 USP47Q96K76 1375 aa25.58■■□□□ 1.69
MAP3K3-201ENST00000361357 APBB1O00213 710 aa25.58■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 E9PSI1 815 aa25.56■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 ARID3AQ99856 593 aa25.54■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 CCDC7Q96M83 1385 aa25.54■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 PANK3Q9H999 370 aa25.54■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.52■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.52■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.52■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 ST18O60284 1047 aa25.52■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.52■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 NGEFQ8N5V2 710 aa25.52■■□□□ 1.68
MAP3K3-201ENST00000361357 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.51■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 PTPRGP23470 1445 aa25.51■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.51■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 PHF14O94880 888 aa25.5■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 NFKBIBQ15653 356 aa25.5■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 HMMRO75330 724 aa25.49■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.48■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.47■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.47■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.46■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 NCAPD3P42695 1498 aa25.46■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 UACAQ9BZF9 1416 aa25.46■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.46■■□□□ 1.67
MAP3K3-201ENST00000361357 KIF21BO75037 1637 aa25.44■■□□□ 1.66
MAP3K3-201ENST00000361357 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.44■■□□□ 1.66
MAP3K3-201ENST00000361357 COG6Q9Y2V7 657 aa25.44■■□□□ 1.66
MAP3K3-201ENST00000361357 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.43■■□□□ 1.66
MAP3K3-201ENST00000361357 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.43■■□□□ 1.66
MAP3K3-201ENST00000361357 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.4■■□□□ 1.66
MAP3K3-201ENST00000361357 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.39■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.39■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.38■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 APAF1O14727 1248 aa25.38■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.37■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 STK31Q9BXU1 1019 aa25.36■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.35■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.35■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 AAMPQ13685 434 aa25.35■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.34■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
MAP3K3-201ENST00000361357 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.32■■□□□ 1.64
MAP3K3-201ENST00000361357 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.31■■□□□ 1.64
MAP3K3-201ENST00000361357 TPM4P67936 248 aa25.31■■□□□ 1.64
MAP3K3-201ENST00000361357 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.31■■□□□ 1.64
MAP3K3-201ENST00000361357 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
MAP3K3-201ENST00000361357 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.3■■□□□ 1.64
MAP3K3-201ENST00000361357 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
MAP3K3-201ENST00000361357 MRE11P49959 708 aa25.29■■□□□ 1.64
MAP3K3-201ENST00000361357 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
MAP3K3-201ENST00000361357 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.28■■□□□ 1.64
MAP3K3-201ENST00000361357 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
MAP3K3-201ENST00000361357 ARAP1Q96P48 1450 aa25.26■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 GPATCH3Q96I76 525 aa25.26■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.635e-7■■■■□ 23.4
MAP3K3-201ENST00000361357 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.25■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 CUX1P39880 1505 aa25.25■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 KIF16BQ96L93 1317 aa25.24■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 EID1Q9Y6B2 187 aa25.24■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 BACH2Q9BYV9 841 aa25.23■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 NPHP1O15259 732 aa25.23■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.23■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.22■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 REC8O95072 547 aa25.22■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.22■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 SYNJ1O43426 1573 aa25.22■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 MIA2Q96PC5 1412 aa25.22■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 NUTM2FA1L443 756 aa25.21■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.21■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 IL27Q8NEV9 243 aa25.21■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 NUCB2P80303 420 aa25.21■■□□□ 1.63
MAP3K3-201ENST00000361357 CFTRP13569 1480 aa25.2■■□□□ 1.62
MAP3K3-201ENST00000361357 NCOA2Q15596 1464 aa25.2■■□□□ 1.62
MAP3K3-201ENST00000361357 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.2■■□□□ 1.62
MAP3K3-201ENST00000361357 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.18■■□□□ 1.62
MAP3K3-201ENST00000361357 KIF3AQ9Y496 699 aa25.18■■□□□ 1.62
MAP3K3-201ENST00000361357 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
MAP3K3-201ENST00000361357 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.17■■□□□ 1.62
MAP3K3-201ENST00000361357 EVC2Q86UK5 1308 aa25.17■■□□□ 1.62
MAP3K3-201ENST00000361357 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms