RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358071.8

RAD9B-201, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAD9B, Length 2,843 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9B-201ENST00000358071 PLA2R1Q13018 1463 aa10.15□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.15□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 CARD11Q9BXL7 1154 aa10.15□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa10.14□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 ABCC1P33527 1531 aa10.14□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 KIF7Q2M1P5 1343 aa10.13□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 ARHGEF5Q12774 1597 aa10.13□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 ANP32CO43423 234 aa10.13□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 FAM69CQ0P6D2 419 aa10.13□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.13□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 CD109Q6YHK3 1445 aa10.12□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.12□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 TSPOAP1O95153 1857 aa10.12□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 MLECQ14165 292 aa10.11□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.11□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 USP47Q96K76 1375 aa10.11□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 RSPH4AQ5TD94 716 aa10.11□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 CCDC144AA2RUR9 1427 aa10.1□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 FAM9BQ8IZU0 186 aa10.1□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 BCORL1Q5H9F3 1711 aa10.09□□□□□ -0.79
RAD9B-201ENST00000358071 BCANQ96GW7 911 aa10.08□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa10.08□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 CCDC7Q96M83 1385 aa10.07□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 A2MP01023 1474 aa10.07□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 ABCA9Q8IUA7 1624 aa10.06□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 ATP7AQ04656 1500 aa10.06□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa10.06□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.05□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 YEATS2Q9ULM3 1422 aa10.05□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.04□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 E9PCH4 1651 aa10.04□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.03□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.03□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa10.03□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.02□□□□□ -0.8
RAD9B-201ENST00000358071 PLXNC1O60486 1568 aa10.02□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 KDM5DQ9BY66 1539 aa10.01□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10.01□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 UNC13BO14795 1591 aa10.01□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 ATP10AO60312 1499 aa10.01□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 ERBINQ96RT1 1412 aa10.01□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 MRS2Q9HD23 443 aa10.01□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 PRAG1Q86YV5 1406 aa10□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 DISP3Q9P2K9 1392 aa10□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 KDM5CP41229 1560 aa9.99□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 CEP152O94986 1710 aa9.99□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.99□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 POGZQ7Z3K3 1410 aa9.98□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.98□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 CLTCL1P53675 1640 aa9.98□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.97□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.97□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.97□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 TESK2Q96S53 571 aa9.97□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 ABCA6Q8N139 1617 aa9.96□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
RAD9B-201ENST00000358071 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.96□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.96□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.95□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 KANK1Q14678 1352 aa9.95□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 NPATQ14207 1427 aa9.95□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 STK26Q9P289 416 aa9.95□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 IDI1Q13907 227 aa9.94□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 PANK3Q9H999 370 aa9.94□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.94□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 FKBP8Q14318 412 aa9.94□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.94□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.93□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 CCER2I3L3R5 266 aa9.92□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 NOS1P29475 1434 aa9.92□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.92□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 MROH2AA6NES4 1674 aa9.92□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.91□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.91□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 DEPDC5O75140 1603 aa9.9□□□□□ -0.82
RAD9B-201ENST00000358071 DIP2BQ9P265 1576 aa9.89□□□□□ -0.83
RAD9B-201ENST00000358071 TET3O43151 1660 aa9.89□□□□□ -0.83
RAD9B-201ENST00000358071 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.89□□□□□ -0.83
RAD9B-201ENST00000358071 TRPM2O94759 1503 aa9.89□□□□□ -0.83
RAD9B-201ENST00000358071 PTPRTO14522 1441 aa9.89□□□□□ -0.83
RAD9B-201ENST00000358071 RICTORQ6R327 1708 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms