RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC184Q52MB2 194 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP1-201ENST00000357436 FANCAO15360 1455 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP1-201ENST00000357436 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCC1P33527 1531 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP1-201ENST00000357436 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF3BO15066 747 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP1-201ENST00000357436 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP1-201ENST00000357436 USP47Q96K76 1375 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM5CP41229 1560 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP1-201ENST00000357436 ADGRL1O94910 1474 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP1-201ENST00000357436 MRS2Q9HD23 443 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP1-201ENST00000357436 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP1-201ENST00000357436 PLA2R1Q13018 1463 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP1-201ENST00000357436 RAPGEF3O95398 923 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP1-201ENST00000357436 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP1-201ENST00000357436 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
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SH3BP1-201ENST00000357436 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP1-201ENST00000357436 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SH3BP1-201ENST00000357436 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP1-201ENST00000357436 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP1-201ENST00000357436 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP1-201ENST00000357436 CD109Q6YHK3 1445 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
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SH3BP1-201ENST00000357436 PLXNC1O60486 1568 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.64■■□□□ 1.69
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SH3BP1-201ENST00000357436 ERBINQ96RT1 1412 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP1-201ENST00000357436 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
SH3BP1-201ENST00000357436 UNC13BO14795 1591 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP1-201ENST00000357436 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
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SH3BP1-201ENST00000357436 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP1-201ENST00000357436 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SH3BP1-201ENST00000357436 A2MP01023 1474 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP1-201ENST00000357436 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP1-201ENST00000357436 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1-201ENST00000357436 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP1-201ENST00000357436 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP1-201ENST00000357436 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP1-201ENST00000357436 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP1-201ENST00000357436 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP1-201ENST00000357436 E9PCH4 1651 aa25.45■■□□□ 1.67
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.44■■□□□ 1.66
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SH3BP1-201ENST00000357436 KANK1Q14678 1352 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP10AO60312 1499 aa25.44■■□□□ 1.66
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SH3BP1-201ENST00000357436 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.43■■□□□ 1.66
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SH3BP1-201ENST00000357436 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP1-201ENST00000357436 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP1-201ENST00000357436 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SH3BP1-201ENST00000357436 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1-201ENST00000357436 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1-201ENST00000357436 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1-201ENST00000357436 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP1-201ENST00000357436 TMC1Q8TDI8 760 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP1-201ENST00000357436 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP1-201ENST00000357436 LAMC1P11047 1609 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP1-201ENST00000357436 NUDCQ9Y266 331 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP1-201ENST00000357436 RALBP1Q15311 655 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP1-201ENST00000357436 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
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SH3BP1-201ENST00000357436 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SH3BP1-201ENST00000357436 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 CLTCL1P53675 1640 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.29■■□□□ 1.64
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SH3BP1-201ENST00000357436 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPOAP1O95153 1857 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 TESK2Q96S53 571 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 DEPDC5O75140 1603 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPRTO14522 1441 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP1-201ENST00000357436 MLECQ14165 292 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TRPM2O94759 1503 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCA6Q8N139 1617 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP152O94986 1710 aa25.24■■□□□ 1.63
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