RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
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USP12-201ENST00000282344 NCAPD3P42695 1498 aa27.48■■□□□ 1.99
USP12-201ENST00000282344 WDR97A6NE52 1622 aa27.47■■□□□ 1.99
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USP12-201ENST00000282344 GBP4Q96PP9 640 aa27.43■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 CFTRP13569 1480 aa27.43■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.42■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 CUX1P39880 1505 aa27.42■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 A0A0G2JS52 829 aa27.41■■□□□ 1.98
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USP12-201ENST00000282344 KCNJ4P48050 445 aa27.4■■□□□ 1.98
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USP12-201ENST00000282344 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.34■■□□□ 1.97
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USP12-201ENST00000282344 TOP2BQ02880 1626 aa27.34■■□□□ 1.97
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USP12-201ENST00000282344 TAOK2Q9UL54 1235 aa27.31■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.31■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.31■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 MCCP23508 829 aa27.31■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 FGD1P98174 961 aa27.3■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 TIAM1Q13009 1591 aa27.3■■□□□ 1.96
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USP12-201ENST00000282344 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 CFAP44Q96MT7 982 aa27.28■■□□□ 1.96
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USP12-201ENST00000282344 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
USP12-201ENST00000282344 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.21■■□□□ 1.95
USP12-201ENST00000282344 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
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USP12-201ENST00000282344 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
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USP12-201ENST00000282344 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 AFAP1Q8N556 730 aa27■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 MTHFSP49914 203 aa26.99■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.99■■□□□ 1.91
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