RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263946.7

PKP1-201, Transcript of plakophilin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP1, Length 5,447 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1-201ENST00000263946 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 MS4A1P11836 297 aa14.76□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 NRDCO43847 1150 aa14.75□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 PDE3BQ13370 1112 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.74□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 NAIPQ13075 1403 aa14.73□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 GOLGA2Q08379 1002 aa14.73□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 HECW1Q76N89 1606 aa14.73□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.73□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 IQGAP2Q13576 1575 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 A0A0G2JS52 829 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP1-201ENST00000263946 CUL7Q14999 1698 aa14.71□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.71□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 MAP3K1Q13233 1512 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 DAPK1P53355 1430 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 STAC3Q96MF2 364 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 CASC1Q6TDU7 716 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 EID1Q9Y6B2 187 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 GRIN2AQ12879 1464 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 EVC2Q86UK5 1308 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 NUTM2FA1L443 756 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP1-201ENST00000263946 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 ROCK1Q13464 1354 aa14.63□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.63□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.62□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.61□□□□□ -0.07
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PKP1-201ENST00000263946 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.61□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.61□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 APAF1O14727 1248 aa14.61□□□□□ -0.07
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PKP1-201ENST00000263946 ARHGEF11O15085 1522 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 ABCC5O15440 1437 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP1-201ENST00000263946 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.59□□□□□ -0.07
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PKP1-201ENST00000263946 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PKP1-201ENST00000263946 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP1-201ENST00000263946 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PKP1-201ENST00000263946 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP1-201ENST00000263946 E9PSI1 815 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP1-201ENST00000263946 RAPGEF3O95398 923 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP1-201ENST00000263946 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP1-201ENST00000263946 NCOA1Q15788 1441 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP1-201ENST00000263946 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.54□□□□□ -0.08
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PKP1-201ENST00000263946 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
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PKP1-201ENST00000263946 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.51□□□□□ -0.09
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PKP1-201ENST00000263946 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PKP1-201ENST00000263946 CRBNQ96SW2 442 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP1-201ENST00000263946 PTPRKQ15262 1439 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP1-201ENST00000263946 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP1-201ENST00000263946 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PKP1-201ENST00000263946 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
PKP1-201ENST00000263946 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
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