RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 HFM1A2PYH4 1435 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 MCCP23508 829 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 GOLGA2Q08379 1002 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 PDE3BQ13370 1112 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRS-201ENST00000262963 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 MIA2Q96PC5 1412 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 AFAP1Q8N556 730 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 IFT140Q96RY7 1462 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 PLCB2Q00722 1185 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 OSCARQ8IYS5 282 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 NAIPQ13075 1403 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.3■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 EID1Q9Y6B2 187 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 PLIN1O60240 522 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 WDR97A6NE52 1622 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 STK31Q9BXU1 1019 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 NRDCO43847 1150 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 CLUAP1Q96AJ1 413 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-201ENST00000262963 APBB1O00213 710 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 SYNJ2O15056 1496 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 APAF1O14727 1248 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 DAPK1P53355 1430 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 HMMRO75330 724 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 HECW1Q76N89 1606 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 MAP3K1Q13233 1512 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC184Q52MB2 194 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRS-201ENST00000262963 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.21■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 NUTM2FA1L443 756 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 GBP4Q96PP9 640 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 AMPHP49418 695 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 PTMSP20962 102 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 CRBNQ96SW2 442 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 CGNL1Q0VF96 1302 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 EVC2Q86UK5 1308 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 IQGAP2Q13576 1575 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 STAC3Q96MF2 364 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 CUL7Q14999 1698 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 E9PSI1 815 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 GPATCH3Q96I76 525 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRS-201ENST00000262963 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 SLC4A10Q6U841 1118 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 ROCK1Q13464 1354 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms