RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262346.6

ANKRD13C-201, Transcript of ankyrin repeat domain 13C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD13C, Length 3,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13C-201ENST00000262346 SKAP1Q86WV1 359 aa14.86□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.84□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.84□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.84□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 RALBP1Q15311 655 aa14.84□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.83□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.83□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 NLRP13Q86W25 1043 aa14.83□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 KDM5CP41229 1560 aa14.83□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.82□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.82□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 ABCA8O94911 1581 aa14.82□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.82□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.81□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.81□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.8□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.79□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 TESK2Q96S53 571 aa14.79□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 TMF1P82094 1093 aa14.79□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.79□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.78□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.77□□□□□ -0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 PLA2R1Q13018 1463 aa14.77□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.77□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.77□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.76□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.76□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.76□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.75□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 KIF3BO15066 747 aa14.75□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.75□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.75□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 A2MP01023 1474 aa14.74□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.71□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.71□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.71□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.71□□□□□ -0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.7□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.7□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 ERBINQ96RT1 1412 aa14.7□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 CRBNQ96SW2 442 aa14.7□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.69□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.69□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 BCL11AQ9H165 835 aa14.69□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.68□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 NEUROD2Q15784 382 aa14.67□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 PPP2R1AP30153 589 aa14.66□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.65□□□□□ -0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 GGT6Q6P531 493 aa14.64□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 PDE4AP27815 886 aa14.63□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 PREX2Q70Z35 1606 aa14.62□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 APAF1O14727 1248 aa14.62□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.62□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 PDE3BQ13370 1112 aa14.61□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.61□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 CHD1O14646 1710 aa14.61□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.61□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 PLCH2O75038 1416 aa14.61□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.6□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.6□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 RGS3P49796 1198 aa14.59□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.59□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.59□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 SLC4A3P48751 1232 aa14.59□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.59□□□□□ -0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 ABCC2Q92887 1545 aa14.57□□□□□ -0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 GOLGA2Q08379 1002 aa14.57□□□□□ -0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 BCAR3O75815 825 aa14.56□□□□□ -0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.56□□□□□ -0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.56□□□□□ -0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 CDCA8Q53HL2 280 aa14.55□□□□□ -0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms