RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.44■■□□□ 1.18
GINS2-201ENST00000253462 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.43■■□□□ 1.18
GINS2-201ENST00000253462 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.42■■□□□ 1.18
GINS2-201ENST00000253462 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.41■■□□□ 1.18
GINS2-201ENST00000253462 PLA2R1Q13018 1463 aa22.41■■□□□ 1.18
GINS2-201ENST00000253462 CCER2I3L3R5 266 aa22.41■■□□□ 1.18
GINS2-201ENST00000253462 FKBP8Q14318 412 aa22.41■■□□□ 1.18
GINS2-201ENST00000253462 CCDC7Q96M83 1385 aa22.39■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 ATP7AQ04656 1500 aa22.39■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.38■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 USP47Q96K76 1375 aa22.38■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 CD109Q6YHK3 1445 aa22.36■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.36■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.36■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.36■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.35■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 KIF3BO15066 747 aa22.35■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.34■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.34■■□□□ 1.17
GINS2-201ENST00000253462 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.32■■□□□ 1.16
GINS2-201ENST00000253462 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.31■■□□□ 1.16
GINS2-201ENST00000253462 KDM5CP41229 1560 aa22.3■■□□□ 1.16
GINS2-201ENST00000253462 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.29■■□□□ 1.16
GINS2-201ENST00000253462 E9PCH4 1651 aa22.28■■□□□ 1.16
GINS2-201ENST00000253462 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
GINS2-201ENST00000253462 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.27■■□□□ 1.16
GINS2-201ENST00000253462 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
GINS2-201ENST00000253462 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
GINS2-201ENST00000253462 A2MP01023 1474 aa22.27■■□□□ 1.16
GINS2-201ENST00000253462 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.26■■□□□ 1.15
GINS2-201ENST00000253462 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.25■■□□□ 1.15
GINS2-201ENST00000253462 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.25■■□□□ 1.15
GINS2-201ENST00000253462 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.25■■□□□ 1.15
GINS2-201ENST00000253462 ATP10AO60312 1499 aa22.25■■□□□ 1.15
GINS2-201ENST00000253462 DEPDC5O75140 1603 aa22.25■■□□□ 1.15
GINS2-201ENST00000253462 KANK1Q14678 1352 aa22.24■■□□□ 1.15
GINS2-201ENST00000253462 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
GINS2-201ENST00000253462 RAPGEF3O95398 923 aa22.22■■□□□ 1.15
GINS2-201ENST00000253462 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.2■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.2■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.2■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 NEFLP07196 543 aa22.2■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 CCDC184Q52MB2 194 aa22.2■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 TET3O43151 1660 aa22.18■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.18■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.17■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.17■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.17■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.17■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 GGT6Q6P531 493 aa22.16■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.16■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 TRPM2O94759 1503 aa22.15■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GINS2-201ENST00000253462 PTPRTO14522 1441 aa22.14■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 CLTCL1P53675 1640 aa22.14■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.12■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.12■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 CEP152O94986 1710 aa22.11■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 NEO1Q92859 1461 aa22.1■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.1■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.09■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 ABCA6Q8N139 1617 aa22.08■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.08■■□□□ 1.13
GINS2-201ENST00000253462 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.08■■□□□ 1.12
GINS2-201ENST00000253462 MRS2Q9HD23 443 aa22.07■■□□□ 1.12
GINS2-201ENST00000253462 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.06■■□□□ 1.12
GINS2-201ENST00000253462 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
GINS2-201ENST00000253462 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.05■■□□□ 1.12
GINS2-201ENST00000253462 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.05■■□□□ 1.12
GINS2-201ENST00000253462 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.03■■□□□ 1.12
GINS2-201ENST00000253462 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
GINS2-201ENST00000253462 MADDQ8WXG6 1647 aa22.02■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 TSPOAP1O95153 1857 aa22.01■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 RICTORQ6R327 1708 aa22■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 TESK2Q96S53 571 aa22■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 MYT1Q01538 1121 aa22■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 LAMC1P11047 1609 aa21.99■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.99■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.98■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 KIF1BO60333 1816 aa21.98■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.98■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.98■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 NPATQ14207 1427 aa21.98■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 GLI2P10070 1586 aa21.97■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 DIP2BQ9P265 1576 aa21.95■■□□□ 1.11
GINS2-201ENST00000253462 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.95■■□□□ 1.1
GINS2-201ENST00000253462 MROH2AA6NES4 1674 aa21.94■■□□□ 1.1
GINS2-201ENST00000253462 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.93■■□□□ 1.1
GINS2-201ENST00000253462 STAC3Q96MF2 364 aa21.93■■□□□ 1.1
GINS2-201ENST00000253462 ABCC3O15438 1527 aa21.93■■□□□ 1.1
GINS2-201ENST00000253462 TMF1P82094 1093 aa21.93■■□□□ 1.1
GINS2-201ENST00000253462 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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