RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.68■■■□□ 2.02
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ODC1-201ENST00000234111 PZPP20742 1482 aa27.65■■■□□ 2.02
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ODC1-201ENST00000234111 ABCC5O15440 1437 aa27.62■■■□□ 2.01
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ODC1-201ENST00000234111 IFT140Q96RY7 1462 aa27.52■■■□□ 2
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ODC1-201ENST00000234111 BECN1Q14457 450 aa27.43■■□□□ 1.98
ODC1-201ENST00000234111 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.42■■□□□ 1.98
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ODC1-201ENST00000234111 ZNF521Q96K83 1311 aa27.25■■□□□ 1.95
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ODC1-201ENST00000234111 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.24■■□□□ 1.95
ODC1-201ENST00000234111 MCM4P33991 863 aa27.23■■□□□ 1.95
ODC1-201ENST00000234111 BCAR3O75815 825 aa27.22■■□□□ 1.95
ODC1-201ENST00000234111 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.22■■□□□ 1.95
ODC1-201ENST00000234111 NUP155O75694 1391 aa27.22■■□□□ 1.95
ODC1-201ENST00000234111 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.21■■□□□ 1.95
ODC1-201ENST00000234111 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.2■■□□□ 1.95
ODC1-201ENST00000234111 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.2■■□□□ 1.95
ODC1-201ENST00000234111 SLFN5Q08AF3 891 aa27.2■■□□□ 1.95
ODC1-201ENST00000234111 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.95
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ODC1-201ENST00000234111 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.19■■□□□ 1.94
ODC1-201ENST00000234111 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.19■■□□□ 1.94
ODC1-201ENST00000234111 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
ODC1-201ENST00000234111 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
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ODC1-201ENST00000234111 MRE11P49959 708 aa27.17■■□□□ 1.94
ODC1-201ENST00000234111 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
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ODC1-201ENST00000234111 TESK2Q96S53 571 aa27.13■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.13■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 CEP170Q5SW79 1584 aa27.11■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.11■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 PPP2R1AP30153 589 aa27.1■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.1■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.1■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.1■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
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