RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222329.8

ERF-201, Transcript of ETS2 repressor factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ERF, Length 2,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERF-201ENST00000222329 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.13■■■□□ 2.57
ERF-201ENST00000222329 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
ERF-201ENST00000222329 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.12■■■□□ 2.57
ERF-201ENST00000222329 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.11■■■□□ 2.57
ERF-201ENST00000222329 PLA2R1Q13018 1463 aa31.06■■■□□ 2.56
ERF-201ENST00000222329 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.05■■■□□ 2.56
ERF-201ENST00000222329 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.05■■■□□ 2.56
ERF-201ENST00000222329 AFAP1Q8N556 730 aa31.04■■■□□ 2.56
ERF-201ENST00000222329 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.02■■■□□ 2.56
ERF-201ENST00000222329 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31■■■□□ 2.55
ERF-201ENST00000222329 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
ERF-201ENST00000222329 PLCH2O75038 1416 aa30.99■■■□□ 2.55
ERF-201ENST00000222329 TMC1Q8TDI8 760 aa30.97■■■□□ 2.55
ERF-201ENST00000222329 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
ERF-201ENST00000222329 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.96■■■□□ 2.55
ERF-201ENST00000222329 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.94■■■□□ 2.54
ERF-201ENST00000222329 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.93■■■□□ 2.54
ERF-201ENST00000222329 A2MP01023 1474 aa30.92■■■□□ 2.54
ERF-201ENST00000222329 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.91■■■□□ 2.54
ERF-201ENST00000222329 UNC13BO14795 1591 aa30.91■■■□□ 2.54
ERF-201ENST00000222329 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
ERF-201ENST00000222329 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
ERF-201ENST00000222329 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.88■■■□□ 2.53
ERF-201ENST00000222329 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
ERF-201ENST00000222329 PLXNC1O60486 1568 aa30.86■■■□□ 2.53
ERF-201ENST00000222329 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.84■■■□□ 2.53
ERF-201ENST00000222329 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
ERF-201ENST00000222329 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.83■■■□□ 2.53
ERF-201ENST00000222329 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.83■■■□□ 2.53
ERF-201ENST00000222329 ABCC1P33527 1531 aa30.81■■■□□ 2.52
ERF-201ENST00000222329 ERBINQ96RT1 1412 aa30.8■■■□□ 2.52
ERF-201ENST00000222329 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.8■■■□□ 2.52
ERF-201ENST00000222329 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.8■■■□□ 2.52
ERF-201ENST00000222329 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
ERF-201ENST00000222329 TESK2Q96S53 571 aa30.78■■■□□ 2.52
ERF-201ENST00000222329 PPP4R2Q9NY27 417 aa30.77■■■□□ 2.52
ERF-201ENST00000222329 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
ERF-201ENST00000222329 KIF3BO15066 747 aa30.73■■■□□ 2.51
ERF-201ENST00000222329 RALBP1Q15311 655 aa30.73■■■□□ 2.51
ERF-201ENST00000222329 PANK3Q9H999 370 aa30.73■■■□□ 2.51
ERF-201ENST00000222329 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
ERF-201ENST00000222329 NUDCQ9Y266 331 aa30.71■■■□□ 2.51
ERF-201ENST00000222329 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.7■■■□□ 2.51
ERF-201ENST00000222329 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.7■■■□□ 2.51
ERF-201ENST00000222329 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.68■■■□□ 2.5
ERF-201ENST00000222329 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
ERF-201ENST00000222329 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
ERF-201ENST00000222329 FANCAO15360 1455 aa30.67■■■□□ 2.5
ERF-201ENST00000222329 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.66■■■□□ 2.5
ERF-201ENST00000222329 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
ERF-201ENST00000222329 TMF1P82094 1093 aa30.65■■■□□ 2.5
ERF-201ENST00000222329 E9PCH4 1651 aa30.64■■■□□ 2.5
ERF-201ENST00000222329 ATP10AO60312 1499 aa30.64■■■□□ 2.49
ERF-201ENST00000222329 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.63■■■□□ 2.49
ERF-201ENST00000222329 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
ERF-201ENST00000222329 ERICH6BQ5W0A0 696 aa30.62■■■□□ 2.49
ERF-201ENST00000222329 NLRP13Q86W25 1043 aa30.62■■■□□ 2.49
ERF-201ENST00000222329 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
ERF-201ENST00000222329 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
ERF-201ENST00000222329 PARD3Q8TEW0 1356 aa30.59■■■□□ 2.49
ERF-201ENST00000222329 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.57■■■□□ 2.48
ERF-201ENST00000222329 ADGRL1O94910 1474 aa30.57■■■□□ 2.48
ERF-201ENST00000222329 ASXL2Q76L83 1435 aa30.56■■■□□ 2.48
ERF-201ENST00000222329 ATP7AQ04656 1500 aa30.54■■■□□ 2.48
ERF-201ENST00000222329 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
ERF-201ENST00000222329 KANK1Q14678 1352 aa30.51■■■□□ 2.48
ERF-201ENST00000222329 ANP32EQ9BTT0 268 aa30.5■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 CLTCL1P53675 1640 aa30.5■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.49■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.49■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.48■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 TRPM2O94759 1503 aa30.47■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 LAMC1P11047 1609 aa30.46■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 PTPRTO14522 1441 aa30.46■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.46■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.46■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 MADDQ8WXG6 1647 aa30.45■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.45■■■□□ 2.47
ERF-201ENST00000222329 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.44■■■□□ 2.46
ERF-201ENST00000222329 BCL11AQ9H165 835 aa30.44■■■□□ 2.46
ERF-201ENST00000222329 RNF123Q5XPI4 1314 aa30.44■■■□□ 2.46
ERF-201ENST00000222329 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.43■■■□□ 2.46
ERF-201ENST00000222329 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.43■■■□□ 2.46
ERF-201ENST00000222329 GGT6Q6P531 493 aa30.42■■■□□ 2.46
ERF-201ENST00000222329 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
ERF-201ENST00000222329 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
ERF-201ENST00000222329 MSH5O43196 834 aa30.4■■■□□ 2.46
ERF-201ENST00000222329 OSCARQ8IYS5 282 aa30.4■■■□□ 2.46
ERF-201ENST00000222329 DEPDC5O75140 1603 aa30.39■■■□□ 2.45
ERF-201ENST00000222329 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
ERF-201ENST00000222329 CEP152O94986 1710 aa30.38■■■□□ 2.45
ERF-201ENST00000222329 TET3O43151 1660 aa30.38■■■□□ 2.45
ERF-201ENST00000222329 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.38■■■□□ 2.45
ERF-201ENST00000222329 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.36■■■□□ 2.45
ERF-201ENST00000222329 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.36■■■□□ 2.45
ERF-201ENST00000222329 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
ERF-201ENST00000222329 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
ERF-201ENST00000222329 PPP2R1AP30153 589 aa30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms