RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219476.7

TSC2-201, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene TSC2, Length 6,156 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-201ENST00000219476 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.53■□□□□ 0.88
TSC2-201ENST00000219476 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.53■□□□□ 0.88
TSC2-201ENST00000219476 PHF14O94880 888 aa20.52■□□□□ 0.88
TSC2-201ENST00000219476 ODF2Q5BJF6 829 aa20.52■□□□□ 0.88
TSC2-201ENST00000219476 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
TSC2-201ENST00000219476 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.51■□□□□ 0.87
TSC2-201ENST00000219476 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TSC2-201ENST00000219476 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TSC2-201ENST00000219476 VPS37DQ86XT2 251 aa20.49■□□□□ 0.87
TSC2-201ENST00000219476 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TSC2-201ENST00000219476 GPS2Q13227 327 aa20.48■□□□□ 0.87
TSC2-201ENST00000219476 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TSC2-201ENST00000219476 TRIM29Q14134 588 aa20.47■□□□□ 0.87
TSC2-201ENST00000219476 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.47■□□□□ 0.87
TSC2-201ENST00000219476 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TSC2-201ENST00000219476 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.46■□□□□ 0.87
TSC2-201ENST00000219476 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.46■□□□□ 0.87
TSC2-201ENST00000219476 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.45■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.45■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.45■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.44■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.42■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 ST18O60284 1047 aa20.42■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.42■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.42■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 BECN2A8MW95 431 aa20.4■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.4■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 MCTP1Q6DN14 999 aa20.4■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.4■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.4■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TSC2-201ENST00000219476 APPP05067 770 aa20.38■□□□□ 0.85
TSC2-201ENST00000219476 CDR1P51861 262 aa20.38■□□□□ 0.85
TSC2-201ENST00000219476 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TSC2-201ENST00000219476 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TSC2-201ENST00000219476 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.35■□□□□ 0.85
TSC2-201ENST00000219476 NGEFQ8N5V2 710 aa20.35■□□□□ 0.85
TSC2-201ENST00000219476 RILPL2Q969X0 211 aa20.35■□□□□ 0.85
TSC2-201ENST00000219476 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TSC2-201ENST00000219476 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TSC2-201ENST00000219476 ERICH2A1L162 156 aa20.35■□□□□ 0.85
TSC2-201ENST00000219476 NUTM2FA1L443 756 aa20.34■□□□□ 0.85
TSC2-201ENST00000219476 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.33■□□□□ 0.85
TSC2-201ENST00000219476 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.32■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 RUFY1Q96T51 708 aa20.31■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 EPS15P42566 896 aa20.31■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.31■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.31■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 CPLX1O14810 134 aa20.31■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.3■□□□□ 0.84
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TSC2-201ENST00000219476 TRDNQ13061 729 aa20.29■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 AK7Q96M32 723 aa20.28■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.28■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TSC2-201ENST00000219476 TEFQ10587 303 aa20.27■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 ZNF592Q92610 1267 aa20.26■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.25■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 GOLGA3Q08378 1498 aa20.25■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.25■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 FOXD1Q16676 465 aa20.24■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.23■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.23■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 FYB1O15117 783 aa20.22■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 OFD1O75665 1012 aa20.22■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.22■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.21■□□□□ 0.83
TSC2-201ENST00000219476 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 HOMER1Q86YM7 354 aa20.2■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 CCDC27Q2M243 656 aa20.2■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 TEX35Q5T0J7 233 aa20.2■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 SLC4A3P48751 1232 aa20.19■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 PKD2Q13563 968 aa20.19■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 KIF27Q86VH2 1401 aa20.19■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.19■□□□□ 0.82
TSC2-201ENST00000219476 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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