RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216268.5

ZBED4-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED4, Length 6,893 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4-201ENST00000216268 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.05□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 FOXD1Q16676 465 aa14.05□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.04□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 DEF6Q9H4E7 631 aa14.04□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.04□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 MSH5O43196 834 aa14.04□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 FGD1P98174 961 aa14.04□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 PDE3BQ13370 1112 aa14.04□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 CDCA8Q53HL2 280 aa14.03□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.03□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 RGL3Q3MIN7 710 aa14.03□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.03□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 KCNJ4P48050 445 aa14.03□□□□□ -0.16
ZBED4-201ENST00000216268 TPM3P06753 285 aa14.02□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.01□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 ESPNB1AK53 854 aa14.01□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.01□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 ST18O60284 1047 aa14.01□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 USP8P40818 1118 aa13.99□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 NEUROD2Q15784 382 aa13.99□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 CARD11Q9BXL7 1154 aa13.99□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 H0YHG0 523 aa13.99□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 TRAK2O60296 914 aa13.99□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 TOPBP1Q92547 1522 aa13.99□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 KIF3AQ9Y496 699 aa13.99□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 RRP1P56182 461 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 AK7Q96M32 723 aa13.99□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC70Q6NSX1 233 aa13.98□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 HSP90B2PQ58FF3 399 aa13.97□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa13.97□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa13.97□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 EXOC6Q8TAG9 804 aa13.97□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 TOP2BQ02880 1626 aa13.96□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
ZBED4-201ENST00000216268 IFT57Q9NWB7 429 aa13.96□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 MNS1Q8NEH6 495 aa13.95□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 GRPEL1Q9HAV7 217 aa13.95□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa13.95□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 RALBP1Q15311 655 aa13.95□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC191Q8NCU4 936 aa13.94□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 PDCL2Q8N4E4 241 aa13.93□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa13.93□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.92□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 HOMER1Q86YM7 354 aa13.92□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.92□□□□□ -0.186e-7■■■■□ 23.3
ZBED4-201ENST00000216268 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.91□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa13.91□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 ERICH4A6NGS2 130 aa13.91□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 CBX1P83916 185 aa13.91□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 GIMAP7Q8NHV1 300 aa13.91□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 FMN1Q68DA7 1419 aa13.91□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa13.9□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 BECN2A8MW95 431 aa13.9□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 NUCB2P80303 420 aa13.9□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 ZSCAN30Q86W11 494 aa13.9□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 ARAP1Q96P48 1450 aa13.9□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 KIF21BO75037 1637 aa13.9□□□□□ -0.18
ZBED4-201ENST00000216268 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 SASS6Q6UVJ0 657 aa13.89□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 ITPRIPQ8IWB1 547 aa13.89□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 GPATCH11Q8N954 259 aa13.88□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 CRBNQ96SW2 442 aa13.88□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 CYB5RLQ6IPT4 315 aa13.88□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 MCTP1Q6DN14 999 aa13.88□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 PHLDB1Q86UU1 1377 aa13.87□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 RUFY1Q96T51 708 aa13.87□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 SETD5Q9C0A6 1442 aa13.87□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.87□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 MLECQ14165 292 aa13.86□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.86□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.86□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 E9PSI1 815 aa13.86□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 CHMP4AQ9BY43 222 aa13.86□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC34Q96HJ3 373 aa13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms