RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000056233.3

NFE2L3-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L3, Length 3,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3-201ENST00000056233 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
NFE2L3-201ENST00000056233 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.66■■□□□ 1.06
NFE2L3-201ENST00000056233 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.66■■□□□ 1.06
NFE2L3-201ENST00000056233 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
NFE2L3-201ENST00000056233 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
NFE2L3-201ENST00000056233 TOPBP1Q92547 1522 aa21.64■■□□□ 1.06
NFE2L3-201ENST00000056233 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.64■■□□□ 1.06
NFE2L3-201ENST00000056233 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.63■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 KDM6BO15054 1643 aa21.62■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 PRDM2Q13029 1718 aa21.61■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 ABCC5O15440 1437 aa21.61■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.61■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.6■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.6■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 HMGXB3Q12766 1538 aa21.59■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.58■■□□□ 1.05
NFE2L3-201ENST00000056233 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.58■■□□□ 1.04
NFE2L3-201ENST00000056233 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.58■■□□□ 1.04
NFE2L3-201ENST00000056233 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3-201ENST00000056233 PPP2R1AP30153 589 aa21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3-201ENST00000056233 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3-201ENST00000056233 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3-201ENST00000056233 MIA2Q96PC5 1412 aa21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3-201ENST00000056233 MORC1Q86VD1 984 aa21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3-201ENST00000056233 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3-201ENST00000056233 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3-201ENST00000056233 SEC24BO95487 1268 aa21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 CDCA8Q53HL2 280 aa21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 IGHDP01880 384 aa21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 C8orf34Q49A92 452 aa21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 GRIN2BQ13224 1484 aa21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 HSCBQ8IWL3 235 aa21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 JPH4Q96JJ6 628 aa21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.47■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 APBB1O00213 710 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 SLC24A1O60721 1099 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
NFE2L3-201ENST00000056233 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.45■■□□□ 1.02
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NFE2L3-201ENST00000056233 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.44■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 TNNQ9UQP3 1299 aa21.43■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 E9PSI1 815 aa21.43■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.43■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.43■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.42■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.42■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 PANK2Q9BZ23 570 aa21.41■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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NFE2L3-201ENST00000056233 CFAP53Q96M91 514 aa21.4■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.39■■□□□ 1.02
NFE2L3-201ENST00000056233 SLFN5Q08AF3 891 aa21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 ROCK1Q13464 1354 aa21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 HECW1Q76N89 1606 aa21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 STK26Q9P289 416 aa21.35■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.34■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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NFE2L3-201ENST00000056233 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.33■■□□□ 1.01
NFE2L3-201ENST00000056233 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.33■■□□□ 1
NFE2L3-201ENST00000056233 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.32■■□□□ 1
NFE2L3-201ENST00000056233 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
NFE2L3-201ENST00000056233 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.32■■□□□ 1
NFE2L3-201ENST00000056233 ERBINQ96RT1 1412 aa21.32■■□□□ 1
NFE2L3-201ENST00000056233 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
NFE2L3-201ENST00000056233 PZPP20742 1482 aa21.31■■□□□ 1
NFE2L3-201ENST00000056233 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.3■■□□□ 1
NFE2L3-201ENST00000056233 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.3■■□□□ 1
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