RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038356.12

Ube2q1-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2q1, Length 3,077 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rundc1Q0VDN7 615 aa29.17■■■□□ 2.26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 PtprtQ99M80 1454 aa29.16■■■□□ 2.26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa29.16■■■□□ 2.26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Caskin1Q6P9K8 1431 aa29.15■■■□□ 2.26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa29.15■■■□□ 2.26
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Plekhg5Q66T02 1073 aa29.14■■■□□ 2.25
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Dapk1Q80YE7 1442 aa29.13■■■□□ 2.25
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Pik3c2gO70167 1506 aa29.1■■■□□ 2.25
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Card11Q8CIS0 1159 aa29.08■■■□□ 2.25
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 NhsB1AV60 1647 aa29.08■■■□□ 2.25
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Trak1Q6PD31 939 aa29.06■■■□□ 2.24
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Igf1rQ60751 1373 aa29.04■■■□□ 2.24
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ttll5Q8CHB8 1328 aa29.03■■■□□ 2.24
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 AlkP97793 1621 aa29.01■■■□□ 2.23
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Map4P27546 1125 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 ChgaP26339 463 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Myom3A2ABU4 1439 aa28.98■■■□□ 2.23
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Wdr7Q920I9 1489 aa28.98■■■□□ 2.23
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Erbb3Q61526 1339 aa28.97■■■□□ 2.23
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 NeflP08551 543 aa28.96■■■□□ 2.23
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Map3k5O35099 1380 aa28.94■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gm156Q58A37 223 aa28.93■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Zbtb4Q5F293 982 aa28.93■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa28.92■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mug2P28666 1451 aa28.92■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rnf17Q99MV7 1640 aa28.91■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa28.91■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cep170Q6A065 1588 aa28.9■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Abca8bQ8K440 1620 aa28.9■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa28.9■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Iqcf3Q9D498 203 aa28.9■■■□□ 2.22
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Naip6Q9JIB6 1403 aa28.89■■■□□ 2.21
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kank1E9Q238 1360 aa28.87■■■□□ 2.21
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 AI481877A2ALV5 1481 aa28.87■■■□□ 2.21
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mbd5B1AYB6 1498 aa28.86■■■□□ 2.21
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ssh2Q5SW75 1423 aa28.86■■■□□ 2.21
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa28.85■■■□□ 2.21
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa28.84■■■□□ 2.21
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Fmn2Q9JL04 1578 aa28.83■■■□□ 2.21
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 DaxxO35613 739 aa28.83■■■□□ 2.21
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 4933416C03RikQ3V063 378 aa28.82■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Zscan21Q07231 555 aa28.8■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cfap74Q3UY96 1578 aa28.79■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Q7TT23 1179 aa28.79■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Lemd3Q9WU40 921 aa28.79■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Irx3P81067 507 aa28.78■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Clstn2Q9ER65 966 aa28.77■■■□□ 2.2
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa28.75■■■□□ 2.19
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kif21bQ9QXL1 1668 aa28.73■■■□□ 2.19
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Abcc3B2RX12 1523 aa28.73■■■□□ 2.19
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 B4galnt3Q6L8S8 986 aa28.73■■■□□ 2.19
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ttll13A4Q9F6 804 aa28.71■■■□□ 2.19
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rock2P70336 1388 aa28.71■■■□□ 2.19
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Zfyve16Q80U44 1528 aa28.7■■■□□ 2.19
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa28.7■■■□□ 2.19
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Prdm16A2A935 1275 aa28.7■■■□□ 2.18
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mink1Q9JM52 1308 aa28.69■■■□□ 2.18
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kif3bQ61771 747 aa28.68■■■□□ 2.18
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Trpm2Q91YD4 1506 aa28.67■■■□□ 2.18
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Erich6D3Z6S9 713 aa28.67■■■□□ 2.18
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Pde4cQ3UEI1 686 aa28.67■■■□□ 2.18
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 CanxP35564 591 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa28.66■■■□□ 2.18
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kidins220E9Q9B7 1793 aa28.66■■■□□ 2.18
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Plcd4Q8K3R3 807 aa28.65■■■□□ 2.18
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa28.64■■■□□ 2.18
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cd109Q8R422 1442 aa28.63■■■□□ 2.17
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Dbr1Q923B1 550 aa28.62■■■□□ 2.17
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mast1Q9R1L5 1570 aa28.6■■■□□ 2.17
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Asxl1P59598 1514 aa28.6■■■□□ 2.17
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28.6■■■□□ 2.17
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Amer1Q7TS75 1132 aa28.59■■■□□ 2.17
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Abca9Q8K449 1623 aa28.57■■■□□ 2.16
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ak9G3UYQ4 1894 aa28.54■■■□□ 2.16
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 PtprgQ05909 1442 aa28.54■■■□□ 2.16
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Pank3Q8R2W9 370 aa28.54■■■□□ 2.16
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Hecw1Q8K4P8 1604 aa28.53■■■□□ 2.16
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Nkx1-2P42580 305 aa28.53■■■□□ 2.16
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Esx1O88933 382 aa28.52■■■□□ 2.16
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 TnikP83510 1323 aa28.52■■■□□ 2.16
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Atp7aQ64430 1491 aa28.51■■■□□ 2.15
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14 ms