RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031145.6

Pdcl2-201, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc12a5Q91V14 1138 aa13.31□□□□□ -0.28
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cep170Q6A065 1588 aa13.31□□□□□ -0.28
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa13.3□□□□□ -0.28
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cnksr2Q80YA9 1032 aa13.3□□□□□ -0.28
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arhgap27A2AB59 869 aa13.29□□□□□ -0.28
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 ChgaP26339 463 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pdcd7Q9WTY1 482 aa13.29□□□□□ -0.28
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PtprtQ99M80 1454 aa13.29□□□□□ -0.28
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Masp1P98064 704 aa13.28□□□□□ -0.28
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Setdb2Q8C267 713 aa13.28□□□□□ -0.28
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NrkQ9R0G8 1455 aa13.26□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pbx2O35984 430 aa13.25□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcc1O35379 1528 aa13.24□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CadpsQ80TJ1 1355 aa13.24□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Klra4Q60651 263 aa13.24□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa13.24□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pla2r1Q62028 1487 aa13.23□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Soga1E1U8D0 1418 aa13.22□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prrt3Q6PE13 971 aa13.22□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Shroom4Q1W617 1475 aa13.22□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lrfn2Q80TG9 788 aa13.21□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 OscarQ8VBT3 265 aa13.2□□□□□ -0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Setd1bQ8CFT2 1985 aa13.19□□□□□ -0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dnajc5gQ8C632 165 aa13.18□□□□□ -0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 SynmQ70IV5 1561 aa13.18□□□□□ -0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Neo1P97798 1493 aa13.17□□□□□ -0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa13.17□□□□□ -0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf354bQ9QXT9 601 aa13.17□□□□□ -0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm11939A2A592 99 aa13.15□□□□□ -0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ric3Q8BPM6 367 aa13.15□□□□□ -0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm14025A2AP89 1413 aa13.13□□□□□ -0.31
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Myt1lP97500 1187 aa13.12□□□□□ -0.31
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PxdnQ3UQ28 1475 aa13.1□□□□□ -0.31
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pprc1Q6NZN1 1644 aa13.1□□□□□ -0.31
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pde8bE9Q4S1 865 aa13.1□□□□□ -0.31
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa13.1□□□□□ -0.31
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rnf166Q3U9F6 237 aa13.09□□□□□ -0.31
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mllt6B1AR10 1109 aa13.08□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa13.07□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rpap1Q80TE0 1409 aa13.07□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcc2Q8VI47 1543 aa13.07□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arid3cA6PWV5 409 aa13.06□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc7a3P70423 618 aa13.06□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Erbb3Q61526 1339 aa13.06□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 WizO88286 1684 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prdm16A2A935 1275 aa13.04□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Unc5aQ8K1S4 898 aa13.04□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Map3k4O08648 1597 aa13.03□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Chd1P40201 1711 aa13.03□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gabbr2Q80T41 940 aa13.03□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 AI481877A2ALV5 1481 aa13.03□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 BC005561E9Q5E2 1589 aa13.03□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa13.03□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Setbp1Q9Z180 1582 aa13.03□□□□□ -0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rem2Q8VEL9 341 aa13.02□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gpatch8A2A6A1 1505 aa13.02□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abca16E9PWJ7 1678 aa13.02□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Foxd4Q60688 444 aa13.01□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Irx6Q9ER75 438 aa13.01□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tmc3Q7TQ69 1130 aa12.99□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Carmil1Q6EDY6 1374 aa12.98□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa12.97□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nudt12Q9DCN1 462 aa12.97□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adamts12Q811B3 1600 aa12.97□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slx4Q6P1D7 1565 aa12.96□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Farp1F8VPU2 1048 aa12.96□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Myt1Q8CFC2 1127 aa12.96□□□□□ -0.33
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm11563B1AQ90 168 aa12.95□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Spryd3E9Q9B3 442 aa12.95□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ciz1Q8VEH2 845 aa12.95□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Emid1Q91VF5 444 aa12.95□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Krtap4-7Q9D732 168 aa12.95□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 WrnO09053 1401 aa12.95□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm11555B1AQ89 175 aa12.94□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ms4a4cQ9D3F6 226 aa12.94□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 GnpatP98192 678 aa12.93□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tpcn2Q8BWC0 731 aa12.92□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 E2f4Q8R0K9 410 aa12.92□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Bcl11bQ99PV8 884 aa12.92□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ak9G3UYQ4 1894 aa12.91□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 XpcP51612 930 aa12.9□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slain2Q8CI08 581 aa12.9□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Igf1rQ60751 1373 aa12.9□□□□□ -0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Psen1P49769 467 aa12.89□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prr7Q3V0I2 269 aa12.88□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arhgap35Q91YM2 1499 aa12.88□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Map3k1P53349 1493 aa12.87□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ano8Q6PB70 1060 aa12.87□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Depdc5P61460 1591 aa12.86□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Clip1Q922J3 1391 aa12.85□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fbxo31Q3TQF0 507 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30 ms