RNA–Protein interactions for RNA: YOR104W

PIN2, Transcript of Exomer-dependent cargo protein, yeast

Gene PIN2, Length 849 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIN2	YOR104W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SNM1	P40993	198 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	AGP3	P43548	558 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	MAL11	P53048	616 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SUR7	P54003	302 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SWP1	Q02795	286 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	ARO10	Q06408	635 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	HFA1	P32874	2273 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YAK1	P14680	807 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	KSS1	P14681	368 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YCR102C	P25608	368 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	CPR3	P25719	182 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YIM1	P28625	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YBR139W	P38109	508 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	MOH1	P38191	138 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	RCY1	P39531	840 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	VHR1	P40522	640 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	CIN1	P40987	1014 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	BAP3	P41815	604 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	IKS1	P47042	667 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YGR168C	P53293	376 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SPR6	Q01684	191 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YDR239C	Q03780	787 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YLR446W	Q06204	433 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	CYK3	Q07533	885 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	RAX1	Q08760	435 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YOR376W	Q08900	122 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	RSA1	Q08932	381 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	TAF3	Q12297	353 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	MRX4	Q12467	430 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	IRA1	P18963	3092 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	TIM9	O74700	87 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	STP22	P25604	385 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	NAM9	P27929	486 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	HCS1	P34243	683 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	AST1	P35183	429 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SER3	P40054	469 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	MPM1	P40364	252 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SMK1	P41808	388 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SNO3	P43544	222 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	FAR7	P43592	221 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	BUL1	P48524	976 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	NUP57	P48837	541 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	RMR1	P53060	241 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	GPG1	P53130	126 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	MTQ1	P53944	314 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	NCE101	Q02820	53 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	DCR2	Q05924	578 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YOL163W	P0CF20	169 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SNF4	P12904	322 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	RPC82	P32349	654 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	ANS1	P38832	159 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
PIN2	YOR104W	SWD1	P39706	426 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SOK1	P40317	901 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SNL1	P40548	159 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	MEH1	Q02205	184 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YPL068C	Q02749	293 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	YPS7	Q06325	596 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	REH1	Q06709	432 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	ENB1	Q08299	606 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	HNT3	Q08702	217 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	BAR1	P12630	587 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	ATR1	P13090	542 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
PIN2	YOR104W	MRPL6	P32904	214 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SLM4	P38247	162 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PIN2	YOR104W	SIC1	P38634	284 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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