RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622939.3

CU633967.1-209, humanhuman

TSL 3

Gene CU633967.1, Length 589 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-209ENST00000622939 GPC3P51654 580 aa8.31□□□□□ -1.08
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CU633967.1-209ENST00000622939 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
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CU633967.1-209ENST00000622939 PHKA2P46019 1235 aa8.28□□□□□ -1.08
CU633967.1-209ENST00000622939 RAB27AP51159 221 aa8.28□□□□□ -1.08
CU633967.1-209ENST00000622939 ITIH3Q06033 890 aa8.28□□□□□ -1.08
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