RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 RNF19AQ9NV58 838 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 TDP2O95551 362 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 LAG3P18627 525 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPC3P51654 580 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 Q4G0T1 1027 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 CASD1Q96PB1 797 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 MUTYHQ9UIF7 546 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 M0R2N6 131 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 FSCN2O14926 492 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 PSMD10O75832 226 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 RNF135Q8IUD6 432 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 MUC6Q6W4X9 2439 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 WDFY4Q6ZS81 3184 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 HOXA2O43364 376 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 DEXIO95424 95 aa23.41■■□□□ 1.34
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TRAPPC3-208ENST00000616074 FGFR4P22455 802 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 DRP2Q13474 957 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 BLIDQ8IZY5 108 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 SCLT1Q96NL6 688 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM150BA6NC51 233 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 CPLX1O14810 134 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP3A7P24462 503 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 PBX3P40426 434 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLCB3Q01970 1234 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 NPY5RQ15761 445 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 MTERF2Q49AM1 385 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRC43Q8N309 656 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 RDM1Q8NG50 284 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 NLRP7Q8WX94 980 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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TRAPPC3-208ENST00000616074 LZTS1Q9Y250 596 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-208ENST00000616074 STBD1O95210 358 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 STK3Q13188 491 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.39■■□□□ 1.33
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TRAPPC3-208ENST00000616074 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.39■■□□□ 1.33
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TRAPPC3-208ENST00000616074 RNF169Q8NCN4 708 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 MBOAT7Q96N66 472 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 CEP89Q96ST8 783 aa23.39■■□□□ 1.33
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TRAPPC3-208ENST00000616074 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.39■■□□□ 1.33
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TRAPPC3-208ENST00000616074 XKR3Q5GH77 459 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF558Q96NG5 402 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 TCF25Q9BQ70 676 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 A0A0U1RQF3 1178 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 FSD2A1L4K1 749 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.37■■□□□ 1.33
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TRAPPC3-208ENST00000616074 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 HIDE1A8MVS5 230 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPM1AP35813 382 aa23.36■■□□□ 1.33
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TRAPPC3-208ENST00000616074 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 INF2Q27J81 1249 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 GALNT17Q6IS24 598 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 HELQQ8TDG4 1101 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF318Q5VUA4 2279 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC37A4O43826 429 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 EOMESO95936 686 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3-208ENST00000616074 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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