RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614428.4

ACACA-231, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACACA, Length 9,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-231	ENST00000614428	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	UCHL3	P15374	230 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	CXCR5	P32302	372 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	TBCC	Q15814	346 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	TPH2	Q8IWU9	490 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	FOXN1	O15353	648 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	TOM1	O60784	492 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	SRGAP2	O75044	1071 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	SFN	P31947	248 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	ZMYND10	O75800	440 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	FDX1	P10109	184 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	STAT4	Q14765	748 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	GTF2H1	P32780	548 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	CENPU	Q71F23	418 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	PIGS	Q96S52	555 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	ERP44	Q9BS26	406 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-231	ENST00000614428	ZBTB22	O15209	634 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ABCB4	P21439	1286 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	BMP6	P22004	513 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PLTP	P55058	493 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	FAM160B2	Q86V87	743 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CREG2	Q8IUH2	290 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	TCP11	Q8WWU5	503 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	INTS13	Q9NVM9	706 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	AP3M2	P53677	418 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	GJA10	Q969M2	543 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	KLHL29	Q96CT2	875 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SERPINB12	Q96P63	405 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PMS2	P54278	862 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SUSD4	Q5VX71	490 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PDIK1L	Q8N165	341 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CEP95	Q96GE4	821 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CENPK	Q9BS16	269 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	RTN2	O75298	545 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	STAM2	O75886	525 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	FTCD	O95954	541 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	MMP14	P50281	582 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	STK4	Q13043	487 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	NLRX1	Q86UT6	975 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	7.14	□□□□□ -1.27	2e-6	■□□□□ 8.9
ACACA-231	ENST00000614428	GBP5	Q96PP8	586 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	EYA4	O95677	639 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CYP2J2	P51589	502 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	MXRA7	P84157	204 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PKN1	Q16512	942 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SLFN13	Q68D06	897 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PGM2	Q96G03	612 aa		7.14	□□□□□ -1.27

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