RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC43Q8N309 656 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 LENG9Q96B70 501 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 MAP7D2Q96T17 732 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 S1PR5Q9H228 398 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 SAMM50Q9Y512 469 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 HIDE1A8MVS5 230 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR64B1ANS9 1081 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF862O60290 1169 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PBX3P40426 434 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPN5P54829 565 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 FGD1P98174 961 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 SYCE2Q6PIF2 218 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 SKAP1Q86WV1 359 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ABI1Q8IZP0 508 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXL6Q8N531 539 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ASIC4Q96FT7 647 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF558Q96NG5 402 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PHOX2BQ99453 314 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PRRX2Q99811 253 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 EDIL3O43854 480 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 OATP04181 439 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 DARSP14868 501 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CPA1P15085 419 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 GPC3P51654 580 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 PRKCEQ02156 737 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT17Q04695 432 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 TCF15Q12870 199 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPN21Q16825 1174 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CLLU1OSQ5K130 101 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZUG5 572 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 TMC7Q7Z402 723 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 BICD2Q8TD16 824 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 BRF1Q92994 677 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 APOL5Q9BWW9 433 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 DISC1Q9NRI5 854 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 NRBP2Q9NSY0 501 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SPG21Q9NZD8 308 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0U1RQF3 1178 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 MSH4O15457 936 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CDC45O75419 566 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 EOMESO95936 686 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SFNP31947 248 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 NTRK3Q16288 839 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 UGCGQ16739 394 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC39A11Q8N1S5 342 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXL16Q8N461 479 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF169Q8NCN4 708 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC148Q8NFR7 591 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CASP10Q92851 521 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNB2Q92953 911 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 PHKBQ93100 1093 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 RIT2Q99578 217 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 C2orf71A6NGG8 1288 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CHMP2AO43633 222 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 GAS7O60861 476 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 FGFR4P22455 802 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SP100P23497 879 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 USP11P51784 963 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 JAK3P52333 1124 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HELQQ8TDG4 1101 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 NLRP7Q8WX94 980 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC5A5Q92911 643 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC136Q96JN2 1154 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SCLT1Q96NL6 688 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 AGXT2Q9BYV1 514 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 UNC45AQ9H3U1 944 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 DACT1Q9NYF0 836 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 VPS54Q9P1Q0 977 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CDH22Q9UJ99 828 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 NR2E1Q9Y466 385 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 MYO10Q9HD67 2058 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 IFNAR1P17181 557 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-226ENST00000593200 AVPR2P30518 371 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms