RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 NECAB1Q8N987 351 aa26.15■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 SPPL3Q8TCT6 385 aa26.15■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.15■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 TMEM150BA6NC51 233 aa26.14■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 GRXCR2A6NFK2 248 aa26.14■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 H3BQ06 376 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 EML1O00423 815 aa26.14■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 CDC42EP1Q00587 391 aa26.14■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 HYAL1Q12794 435 aa26.14■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 DRP2Q13474 957 aa26.14■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 SCLT1Q96NL6 688 aa26.14■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 CLDND1Q9NY35 253 aa26.14■■□□□ 1.78
MBD3-211ENST00000592965 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 DNAJB1P25685 340 aa26.13■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 KRT2P35908 639 aa26.13■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 ANO5Q75V66 913 aa26.13■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 NLRP7Q8WX94 980 aa26.13■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 HAS1Q92839 578 aa26.13■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 TNFRSF25Q93038 417 aa26.13■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.13■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 AAASQ9NRG9 546 aa26.13■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 HOXA2O43364 376 aa26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 MAFO75444 373 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 LTBRP36941 435 aa26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 QARSP47897 775 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 DNM2P50570 870 aa26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 NEK4P51957 841 aa26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 FAM178BQ8IXR5 827 aa26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 PPP2R3CQ969Q6 453 aa26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 TMEM117Q9H0C3 514 aa26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa26.12■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 ARID2Q68CP9 1835 aa26.11■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 FGFR1P11362 822 aa26.11■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 IL9P15248 144 aa26.11■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 NR5A1Q13285 461 aa26.11■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.11■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 EP400NLQ6ZTU2 488 aa26.11■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 POTEDQ86YR6 584 aa26.11■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 POF1BQ8WVV4 589 aa26.11■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.11■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 RNF19AQ9NV58 838 aa26.11■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 C5orf42Q9H799 3197 aa26.11■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 FAM205CA6NFA0 338 aa26.1■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 P4HBP07237 508 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 UBE3AQ05086 875 aa26.1■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 PLA2G4FQ68DD2 849 aa26.1■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 ZNF410Q86VK4 478 aa26.1■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.1■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 CYP26B1Q9NR63 512 aa26.1■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 FAM50BQ9Y247 325 aa26.1■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 PPME1Q9Y570 386 aa26.1■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 CSPG5O95196 566 aa26.09■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 LAG3P18627 525 aa26.09■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.09■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa26.09■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa26.09■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 CWH43Q9H720 699 aa26.09■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 CD320Q9NPF0 282 aa26.09■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 DACT1Q9NYF0 836 aa26.09■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 HCSTQ9UBK5 93 aa26.09■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 A0A0U1RQF3 1178 aa26.08■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 SEC24BO95487 1268 aa26.08■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 FGFR4P22455 802 aa26.08■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 IRS1P35568 1242 aa26.08■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.08■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 EPHA7Q15375 998 aa26.08■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 CASD1Q96PB1 797 aa26.08■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 CHST12Q9NRB3 414 aa26.08■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
MBD3-211ENST00000592965 A0A087WZ62 844 aa26.07■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 MARCH6O60337 910 aa26.07■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 JAK2O60674 1132 aa26.07■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 FGF18O76093 207 aa26.07■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.769e-7■■□□□ 14
MBD3-211ENST00000592965 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.761e-7■■■■□ 22.5
MBD3-211ENST00000592965 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 C4orf19Q8IY42 314 aa26.07■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 EXOC8Q8IYI6 725 aa26.07■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 LRRC43Q8N309 656 aa26.07■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 SLC7A3Q8WY07 619 aa26.07■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 LXNQ9BS40 222 aa26.07■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 TBX10O75333 385 aa26.06■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 EOMESO95936 686 aa26.06■■□□□ 1.76
MBD3-211ENST00000592965 NPEPPSP55786 919 aa26.06■■□□□ 1.76
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