RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592815.5

CIRBP-240, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene CIRBP, Length 334 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-240ENST00000592815 FAM50BQ9Y247 325 aa18.09■□□□□ 0.49
CIRBP-240ENST00000592815 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CIRBP-240ENST00000592815 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa18.09■□□□□ 0.49
CIRBP-240ENST00000592815 SLC37A4O43826 429 aa18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 CTDNEP1O95476 244 aa18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 AK2P54819 239 aa18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 DRP2Q13474 957 aa18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 ANKRD1Q15327 319 aa18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 CLUL1Q15846 466 aa18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 OXER1Q8TDS5 423 aa18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 NLRP7Q8WX94 980 aa18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 PPP2R3CQ969Q6 453 aa18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 HCSTQ9UBK5 93 aa18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa18.08■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 STK36Q9NRP7 1315 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 EML1O00423 815 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 LINC01565O15544 149 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 FGFR4P22455 802 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 DNM2P50570 870 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 PSMC5P62195 406 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 ADAM15Q13444 863 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 PPP4R3AQ6IN85 833 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 NEK8Q86SG6 692 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
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CIRBP-240ENST00000592815 FAM20AQ96MK3 541 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 CEP89Q96ST8 783 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 PI4K2BG5E9Z4 385 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 MARCH6O60337 910 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 FGF18O76093 207 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 CDC42EP1Q00587 391 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 THNSL1Q8IYQ7 743 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 RNF169Q8NCN4 708 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 WASF1Q92558 559 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 CWH43Q9H720 699 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 KCNMB3Q9NPA1 279 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa18.06■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 HOXA2O43364 376 aa18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 MAFO75444 373 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
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CIRBP-240ENST00000592815 UBE3AQ05086 875 aa18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 PPP2R5CQ13362 524 aa18.05■□□□□ 0.48
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CIRBP-240ENST00000592815 RNF19AQ9NV58 838 aa18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 VAV3Q9UKW4 847 aa18.05■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 A0A087WZ62 844 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 TBX10O75333 385 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 LAG3P18627 525 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 QARSP47897 775 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 NDUFV1P49821 464 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 ME3Q16798 604 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 TMEM31Q5JXX7 168 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 PLA2G4FQ68DD2 849 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 LRRC55Q6ZSA7 311 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 EFHBQ8N7U6 833 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 HAS1Q92839 578 aa18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
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CIRBP-240ENST00000592815 A0A0U1RQF3 1178 aa18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 PER2O15055 1255 aa18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 MBTPS2O43462 519 aa18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
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CIRBP-240ENST00000592815 ERVFC1P60507 584 aa18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 ZP2Q05996 745 aa18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 NR5A1Q13285 461 aa18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 KSR1Q8IVT5 923 aa18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 ADHFE1Q8IWW8 467 aa18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 CYP26B1Q9NR63 512 aa18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 TLR9Q9NR96 1032 aa18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 CHST12Q9NRB3 414 aa18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 DACT1Q9NYF0 836 aa18.03■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 FAM86C2PA6NEL3 165 aa18.02■□□□□ 0.48
CIRBP-240ENST00000592815 FAM205CA6NFA0 338 aa18.02■□□□□ 0.48
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