RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL1A2	P08123	1366 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLCN3	P51790	818 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIFAP3	Q92845	792 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLS3	P13797	630 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAP43	P17677	238 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PEX3	P56589	373 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	BSND	Q8WZ55	320 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRIN2D	O15399	1336 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAGEB2	O15479	319 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GJB1	P08034	283 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARL2	P36404	184 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CASP5	P51878	434 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADAM17	P78536	824 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMD2	Q13200	908 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	FIZ1	Q96SL8	496 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSPY26P	Q9H489	355 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYH11	P35749	1972 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	EVPL	Q92817	2033 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	KBTBD13	C9JR72	458 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRCP	P42785	496 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MLKL	Q8NB16	471 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PQY0	241 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNM1L	O00429	736 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TREH	O43280	583 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CABYR	O75952	493 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GLRA2	P23416	452 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXC8	P31273	242 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPTX2	P47972	431 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	RTP1	P59025	263 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	IER5	Q5VY09	327 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	KSR1	Q8IVT5	923 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC169	A6NNP5	214 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GCNT3	O95395	438 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SGPL1	O95470	568 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNM2	P50570	870 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCP11	Q8WWU5	503 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYB	P10242	640 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNAT1	P11488	350 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMOD1	P28289	359 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFT74	Q96LB3	600 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHF24	Q9UPV7	400 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC16A4	O15374	487 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms