RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 QARSP47897 775 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RARRES1P49788 294 aa18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PGM5Q15124 567 aa18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STK33Q9BYT3 514 aa18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM206Q9H813 350 aa18■□□□□ 0.47
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CBWD3Q5JTY5 395 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CBWD5Q5RIA9 395 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SYCP3Q8IZU3 236 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TIPINQ9BVW5 301 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSD3Q9NYI0 1048 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PHIPQ8WWQ0 1821 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 F8VZ95 297 aa17.98■□□□□ 0.47
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EXOC3O60645 756 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLS3P13797 630 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MTMR2Q13614 643 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C4orf19Q8IY42 314 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EXOC4Q96A65 974 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SELENOOQ9BVL4 669 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HOMER2Q9NSB8 354 aa17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa17.98■□□□□ 0.47
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.473e-23■■■■□ 26.7
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRRC57Q8N9N7 239 aa17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC30A5Q8TAD4 765 aa17.97■□□□□ 0.47
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MS4A14Q96JA4 679 aa17.97■□□□□ 0.47
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STIM2Q9P246 746 aa17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 APEX2Q9UBZ4 518 aa17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNAJC12Q9UKB3 198 aa17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADAM21Q9UKJ8 722 aa17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARID2Q68CP9 1835 aa17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 H2AFZP0C0S5 128 aa17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM49P0CI25 452 aa17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM49CP0CI26 452 aa17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 JAK3P52333 1124 aa17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYL7Q01449 175 aa17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C8orf74Q6P047 294 aa17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF207Q6ZRF8 634 aa17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 H2AFVQ71UI9 128 aa17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRERF1Q96PN7 1200 aa17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACCSQ96QU6 501 aa17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VWA5AO00534 786 aa17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SFNP31947 248 aa17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPEPPSP55786 919 aa17.95■□□□□ 0.46
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